Protein–RNA interactions for Protein: Q96N35

LINC00052, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00052, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00052Q96N35 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
LINC00052Q96N35 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
LINC00052Q96N35 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LINC00052Q96N35 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LINC00052Q96N35 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LINC00052Q96N35 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LINC00052Q96N35 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LINC00052Q96N35 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LINC00052Q96N35 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LINC00052Q96N35 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LINC00052Q96N35 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LINC00052Q96N35 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LINC00052Q96N35 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LINC00052Q96N35 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LINC00052Q96N35 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LINC00052Q96N35 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LINC00052Q96N35 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LINC00052Q96N35 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LINC00052Q96N35 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LINC00052Q96N35 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LINC00052Q96N35 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LINC00052Q96N35 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LINC00052Q96N35 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LINC00052Q96N35 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LINC00052Q96N35 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LINC00052Q96N35 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LINC00052Q96N35 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LINC00052Q96N35 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LINC00052Q96N35 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LINC00052Q96N35 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LINC00052Q96N35 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LINC00052Q96N35 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LINC00052Q96N35 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LINC00052Q96N35 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LINC00052Q96N35 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LINC00052Q96N35 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LINC00052Q96N35 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LINC00052Q96N35 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LINC00052Q96N35 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LINC00052Q96N35 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LINC00052Q96N35 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
LINC00052Q96N35 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
LINC00052Q96N35 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LINC00052Q96N35 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LINC00052Q96N35 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LINC00052Q96N35 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LINC00052Q96N35 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LINC00052Q96N35 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LINC00052Q96N35 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LINC00052Q96N35 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LINC00052Q96N35 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LINC00052Q96N35 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LINC00052Q96N35 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LINC00052Q96N35 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LINC00052Q96N35 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LINC00052Q96N35 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LINC00052Q96N35 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LINC00052Q96N35 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LINC00052Q96N35 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LINC00052Q96N35 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LINC00052Q96N35 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LINC00052Q96N35 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LINC00052Q96N35 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LINC00052Q96N35 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LINC00052Q96N35 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LINC00052Q96N35 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LINC00052Q96N35 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LINC00052Q96N35 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LINC00052Q96N35 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LINC00052Q96N35 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LINC00052Q96N35 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LINC00052Q96N35 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LINC00052Q96N35 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LINC00052Q96N35 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LINC00052Q96N35 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
LINC00052Q96N35 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LINC00052Q96N35 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LINC00052Q96N35 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LINC00052Q96N35 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LINC00052Q96N35 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
LINC00052Q96N35 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LINC00052Q96N35 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LINC00052Q96N35 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LINC00052Q96N35 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LINC00052Q96N35 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LINC00052Q96N35 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LINC00052Q96N35 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LINC00052Q96N35 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LINC00052Q96N35 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LINC00052Q96N35 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LINC00052Q96N35 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LINC00052Q96N35 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LINC00052Q96N35 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LINC00052Q96N35 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LINC00052Q96N35 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LINC00052Q96N35 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LINC00052Q96N35 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LINC00052Q96N35 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LINC00052Q96N35 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LINC00052Q96N35 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.7 ms