Protein–RNA interactions for Protein: Q96MW5

COG8, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG8Q96MW5 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
COG8Q96MW5 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
COG8Q96MW5 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
COG8Q96MW5 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
COG8Q96MW5 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
COG8Q96MW5 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
COG8Q96MW5 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
COG8Q96MW5 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
COG8Q96MW5 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
COG8Q96MW5 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
COG8Q96MW5 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
COG8Q96MW5 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
COG8Q96MW5 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
COG8Q96MW5 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
COG8Q96MW5 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
COG8Q96MW5 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
COG8Q96MW5 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
COG8Q96MW5 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
COG8Q96MW5 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
COG8Q96MW5 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
COG8Q96MW5 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
COG8Q96MW5 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
COG8Q96MW5 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
COG8Q96MW5 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
COG8Q96MW5 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
COG8Q96MW5 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
COG8Q96MW5 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
COG8Q96MW5 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
COG8Q96MW5 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
COG8Q96MW5 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
COG8Q96MW5 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
COG8Q96MW5 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
COG8Q96MW5 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
COG8Q96MW5 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
COG8Q96MW5 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
COG8Q96MW5 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
COG8Q96MW5 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
COG8Q96MW5 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
COG8Q96MW5 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
COG8Q96MW5 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
COG8Q96MW5 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
COG8Q96MW5 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
COG8Q96MW5 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
COG8Q96MW5 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
COG8Q96MW5 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
COG8Q96MW5 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
COG8Q96MW5 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
COG8Q96MW5 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
COG8Q96MW5 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
COG8Q96MW5 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
COG8Q96MW5 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
COG8Q96MW5 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
COG8Q96MW5 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
COG8Q96MW5 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
COG8Q96MW5 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
COG8Q96MW5 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
COG8Q96MW5 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
COG8Q96MW5 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
COG8Q96MW5 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
COG8Q96MW5 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
COG8Q96MW5 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
COG8Q96MW5 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
COG8Q96MW5 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
COG8Q96MW5 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
COG8Q96MW5 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
COG8Q96MW5 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
COG8Q96MW5 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
COG8Q96MW5 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
COG8Q96MW5 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
COG8Q96MW5 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
COG8Q96MW5 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
COG8Q96MW5 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
COG8Q96MW5 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
COG8Q96MW5 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
COG8Q96MW5 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
COG8Q96MW5 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
COG8Q96MW5 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
COG8Q96MW5 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
COG8Q96MW5 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
COG8Q96MW5 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
COG8Q96MW5 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
COG8Q96MW5 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
COG8Q96MW5 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
COG8Q96MW5 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
COG8Q96MW5 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
COG8Q96MW5 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
COG8Q96MW5 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
COG8Q96MW5 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
COG8Q96MW5 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
COG8Q96MW5 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
COG8Q96MW5 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
COG8Q96MW5 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
COG8Q96MW5 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
COG8Q96MW5 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
COG8Q96MW5 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
COG8Q96MW5 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
COG8Q96MW5 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
COG8Q96MW5 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
COG8Q96MW5 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
COG8Q96MW5 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms