Protein–RNA interactions for Protein: Q96M94

KLHL15, Kelch-like protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL15Q96M94 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KLHL15Q96M94 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KLHL15Q96M94 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KLHL15Q96M94 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
KLHL15Q96M94 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KLHL15Q96M94 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KLHL15Q96M94 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KLHL15Q96M94 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KLHL15Q96M94 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
KLHL15Q96M94 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
KLHL15Q96M94 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
KLHL15Q96M94 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KLHL15Q96M94 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KLHL15Q96M94 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KLHL15Q96M94 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KLHL15Q96M94 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KLHL15Q96M94 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KLHL15Q96M94 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KLHL15Q96M94 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KLHL15Q96M94 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KLHL15Q96M94 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KLHL15Q96M94 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KLHL15Q96M94 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KLHL15Q96M94 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KLHL15Q96M94 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KLHL15Q96M94 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KLHL15Q96M94 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KLHL15Q96M94 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KLHL15Q96M94 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KLHL15Q96M94 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KLHL15Q96M94 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
KLHL15Q96M94 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
KLHL15Q96M94 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KLHL15Q96M94 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KLHL15Q96M94 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KLHL15Q96M94 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KLHL15Q96M94 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KLHL15Q96M94 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KLHL15Q96M94 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KLHL15Q96M94 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KLHL15Q96M94 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KLHL15Q96M94 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KLHL15Q96M94 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KLHL15Q96M94 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KLHL15Q96M94 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KLHL15Q96M94 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KLHL15Q96M94 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KLHL15Q96M94 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
KLHL15Q96M94 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
KLHL15Q96M94 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KLHL15Q96M94 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KLHL15Q96M94 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
KLHL15Q96M94 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KLHL15Q96M94 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KLHL15Q96M94 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KLHL15Q96M94 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KLHL15Q96M94 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
KLHL15Q96M94 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
KLHL15Q96M94 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KLHL15Q96M94 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KLHL15Q96M94 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KLHL15Q96M94 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KLHL15Q96M94 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KLHL15Q96M94 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KLHL15Q96M94 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KLHL15Q96M94 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KLHL15Q96M94 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KLHL15Q96M94 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KLHL15Q96M94 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KLHL15Q96M94 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KLHL15Q96M94 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KLHL15Q96M94 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KLHL15Q96M94 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KLHL15Q96M94 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KLHL15Q96M94 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KLHL15Q96M94 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KLHL15Q96M94 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KLHL15Q96M94 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KLHL15Q96M94 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KLHL15Q96M94 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KLHL15Q96M94 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KLHL15Q96M94 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KLHL15Q96M94 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KLHL15Q96M94 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KLHL15Q96M94 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KLHL15Q96M94 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KLHL15Q96M94 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KLHL15Q96M94 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KLHL15Q96M94 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KLHL15Q96M94 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KLHL15Q96M94 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KLHL15Q96M94 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KLHL15Q96M94 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KLHL15Q96M94 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KLHL15Q96M94 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KLHL15Q96M94 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KLHL15Q96M94 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KLHL15Q96M94 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
KLHL15Q96M94 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KLHL15Q96M94 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.4 ms