Protein–RNA interactions for Protein: Q96LW2

SGK494, Uncharacterized serine/threonine-protein kinase SgK494, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGK494Q96LW2 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SGK494Q96LW2 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SGK494Q96LW2 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SGK494Q96LW2 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SGK494Q96LW2 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SGK494Q96LW2 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SGK494Q96LW2 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SGK494Q96LW2 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SGK494Q96LW2 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SGK494Q96LW2 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SGK494Q96LW2 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SGK494Q96LW2 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SGK494Q96LW2 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SGK494Q96LW2 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SGK494Q96LW2 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SGK494Q96LW2 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SGK494Q96LW2 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SGK494Q96LW2 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
SGK494Q96LW2 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SGK494Q96LW2 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SGK494Q96LW2 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SGK494Q96LW2 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SGK494Q96LW2 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SGK494Q96LW2 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SGK494Q96LW2 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SGK494Q96LW2 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SGK494Q96LW2 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SGK494Q96LW2 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SGK494Q96LW2 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SGK494Q96LW2 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SGK494Q96LW2 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SGK494Q96LW2 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SGK494Q96LW2 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SGK494Q96LW2 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SGK494Q96LW2 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SGK494Q96LW2 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SGK494Q96LW2 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SGK494Q96LW2 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SGK494Q96LW2 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SGK494Q96LW2 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SGK494Q96LW2 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SGK494Q96LW2 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SGK494Q96LW2 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SGK494Q96LW2 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SGK494Q96LW2 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SGK494Q96LW2 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SGK494Q96LW2 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SGK494Q96LW2 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SGK494Q96LW2 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SGK494Q96LW2 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SGK494Q96LW2 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SGK494Q96LW2 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SGK494Q96LW2 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SGK494Q96LW2 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SGK494Q96LW2 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SGK494Q96LW2 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SGK494Q96LW2 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SGK494Q96LW2 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SGK494Q96LW2 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SGK494Q96LW2 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SGK494Q96LW2 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SGK494Q96LW2 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SGK494Q96LW2 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SGK494Q96LW2 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SGK494Q96LW2 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SGK494Q96LW2 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SGK494Q96LW2 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SGK494Q96LW2 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SGK494Q96LW2 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SGK494Q96LW2 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SGK494Q96LW2 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SGK494Q96LW2 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SGK494Q96LW2 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SGK494Q96LW2 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
SGK494Q96LW2 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SGK494Q96LW2 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SGK494Q96LW2 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SGK494Q96LW2 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
SGK494Q96LW2 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SGK494Q96LW2 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SGK494Q96LW2 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SGK494Q96LW2 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SGK494Q96LW2 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SGK494Q96LW2 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SGK494Q96LW2 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SGK494Q96LW2 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SGK494Q96LW2 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SGK494Q96LW2 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SGK494Q96LW2 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SGK494Q96LW2 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SGK494Q96LW2 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SGK494Q96LW2 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SGK494Q96LW2 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SGK494Q96LW2 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SGK494Q96LW2 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SGK494Q96LW2 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SGK494Q96LW2 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SGK494Q96LW2 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SGK494Q96LW2 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SGK494Q96LW2 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms