Protein–RNA interactions for Protein: Q96LW1

ZNF354B, Zinc finger protein 354B, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF354BQ96LW1 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZNF354BQ96LW1 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZNF354BQ96LW1 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZNF354BQ96LW1 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZNF354BQ96LW1 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZNF354BQ96LW1 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
ZNF354BQ96LW1 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZNF354BQ96LW1 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZNF354BQ96LW1 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
ZNF354BQ96LW1 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZNF354BQ96LW1 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZNF354BQ96LW1 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZNF354BQ96LW1 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZNF354BQ96LW1 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZNF354BQ96LW1 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZNF354BQ96LW1 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZNF354BQ96LW1 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZNF354BQ96LW1 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZNF354BQ96LW1 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZNF354BQ96LW1 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZNF354BQ96LW1 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZNF354BQ96LW1 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZNF354BQ96LW1 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZNF354BQ96LW1 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZNF354BQ96LW1 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
ZNF354BQ96LW1 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ZNF354BQ96LW1 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ZNF354BQ96LW1 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ZNF354BQ96LW1 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ZNF354BQ96LW1 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ZNF354BQ96LW1 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
ZNF354BQ96LW1 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZNF354BQ96LW1 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZNF354BQ96LW1 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZNF354BQ96LW1 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
ZNF354BQ96LW1 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZNF354BQ96LW1 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZNF354BQ96LW1 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZNF354BQ96LW1 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZNF354BQ96LW1 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZNF354BQ96LW1 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZNF354BQ96LW1 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZNF354BQ96LW1 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZNF354BQ96LW1 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZNF354BQ96LW1 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZNF354BQ96LW1 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZNF354BQ96LW1 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZNF354BQ96LW1 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZNF354BQ96LW1 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZNF354BQ96LW1 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZNF354BQ96LW1 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZNF354BQ96LW1 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZNF354BQ96LW1 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZNF354BQ96LW1 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZNF354BQ96LW1 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZNF354BQ96LW1 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZNF354BQ96LW1 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZNF354BQ96LW1 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZNF354BQ96LW1 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZNF354BQ96LW1 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZNF354BQ96LW1 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZNF354BQ96LW1 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZNF354BQ96LW1 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ZNF354BQ96LW1 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ZNF354BQ96LW1 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZNF354BQ96LW1 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
ZNF354BQ96LW1 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZNF354BQ96LW1 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
ZNF354BQ96LW1 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZNF354BQ96LW1 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZNF354BQ96LW1 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZNF354BQ96LW1 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
ZNF354BQ96LW1 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZNF354BQ96LW1 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZNF354BQ96LW1 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZNF354BQ96LW1 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZNF354BQ96LW1 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZNF354BQ96LW1 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZNF354BQ96LW1 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZNF354BQ96LW1 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZNF354BQ96LW1 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZNF354BQ96LW1 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZNF354BQ96LW1 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZNF354BQ96LW1 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZNF354BQ96LW1 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZNF354BQ96LW1 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZNF354BQ96LW1 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZNF354BQ96LW1 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZNF354BQ96LW1 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
ZNF354BQ96LW1 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZNF354BQ96LW1 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
ZNF354BQ96LW1 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZNF354BQ96LW1 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZNF354BQ96LW1 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZNF354BQ96LW1 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZNF354BQ96LW1 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZNF354BQ96LW1 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZNF354BQ96LW1 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZNF354BQ96LW1 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZNF354BQ96LW1 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 350.8 ms