Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT9

RNPC3, RNA-binding protein 40, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNPC3Q96LT9 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
RNPC3Q96LT9 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
RNPC3Q96LT9 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC30.51■■■□□ 2.48
RNPC3Q96LT9 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
RNPC3Q96LT9 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
RNPC3Q96LT9 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
RNPC3Q96LT9 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
RNPC3Q96LT9 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.49■■■□□ 2.47
RNPC3Q96LT9 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
RNPC3Q96LT9 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
RNPC3Q96LT9 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
RNPC3Q96LT9 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
RNPC3Q96LT9 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
RNPC3Q96LT9 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
RNPC3Q96LT9 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
RNPC3Q96LT9 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
RNPC3Q96LT9 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
RNPC3Q96LT9 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
RNPC3Q96LT9 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
RNPC3Q96LT9 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
RNPC3Q96LT9 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
RNPC3Q96LT9 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
RNPC3Q96LT9 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC30.38■■■□□ 2.45
RNPC3Q96LT9 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
RNPC3Q96LT9 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
RNPC3Q96LT9 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
RNPC3Q96LT9 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
RNPC3Q96LT9 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
RNPC3Q96LT9 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC30.32■■■□□ 2.44
RNPC3Q96LT9 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
RNPC3Q96LT9 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
RNPC3Q96LT9 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
RNPC3Q96LT9 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
RNPC3Q96LT9 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
RNPC3Q96LT9 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
RNPC3Q96LT9 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
RNPC3Q96LT9 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
RNPC3Q96LT9 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
RNPC3Q96LT9 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
RNPC3Q96LT9 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
RNPC3Q96LT9 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
RNPC3Q96LT9 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
RNPC3Q96LT9 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
RNPC3Q96LT9 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
RNPC3Q96LT9 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC30.24■■■□□ 2.43
RNPC3Q96LT9 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
RNPC3Q96LT9 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
RNPC3Q96LT9 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
RNPC3Q96LT9 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
RNPC3Q96LT9 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
RNPC3Q96LT9 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
RNPC3Q96LT9 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
RNPC3Q96LT9 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
RNPC3Q96LT9 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
RNPC3Q96LT9 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.17■■■□□ 2.42
RNPC3Q96LT9 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
RNPC3Q96LT9 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
RNPC3Q96LT9 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC30.15■■■□□ 2.42
RNPC3Q96LT9 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
RNPC3Q96LT9 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
RNPC3Q96LT9 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
RNPC3Q96LT9 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
RNPC3Q96LT9 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
RNPC3Q96LT9 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
RNPC3Q96LT9 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
RNPC3Q96LT9 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
RNPC3Q96LT9 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
RNPC3Q96LT9 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
RNPC3Q96LT9 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
RNPC3Q96LT9 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
RNPC3Q96LT9 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
RNPC3Q96LT9 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
RNPC3Q96LT9 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
RNPC3Q96LT9 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
RNPC3Q96LT9 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
RNPC3Q96LT9 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
RNPC3Q96LT9 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
RNPC3Q96LT9 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC30.03■■■□□ 2.4
RNPC3Q96LT9 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
RNPC3Q96LT9 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
RNPC3Q96LT9 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
RNPC3Q96LT9 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
RNPC3Q96LT9 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
RNPC3Q96LT9 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
RNPC3Q96LT9 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
RNPC3Q96LT9 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
RNPC3Q96LT9 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
RNPC3Q96LT9 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
RNPC3Q96LT9 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
RNPC3Q96LT9 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
RNPC3Q96LT9 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
RNPC3Q96LT9 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
RNPC3Q96LT9 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
RNPC3Q96LT9 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
RNPC3Q96LT9 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
RNPC3Q96LT9 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
RNPC3Q96LT9 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
RNPC3Q96LT9 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
RNPC3Q96LT9 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
RNPC3Q96LT9 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms