Protein–RNA interactions for Protein: Q96KJ9

COX4I2, Cytochrome c oxidase subunit 4 isoform 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX4I2Q96KJ9 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
COX4I2Q96KJ9 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
COX4I2Q96KJ9 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
COX4I2Q96KJ9 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
COX4I2Q96KJ9 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
COX4I2Q96KJ9 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
COX4I2Q96KJ9 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
COX4I2Q96KJ9 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
COX4I2Q96KJ9 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
COX4I2Q96KJ9 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
COX4I2Q96KJ9 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
COX4I2Q96KJ9 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
COX4I2Q96KJ9 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
COX4I2Q96KJ9 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
COX4I2Q96KJ9 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
COX4I2Q96KJ9 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
COX4I2Q96KJ9 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
COX4I2Q96KJ9 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
COX4I2Q96KJ9 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
COX4I2Q96KJ9 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
COX4I2Q96KJ9 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
COX4I2Q96KJ9 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
COX4I2Q96KJ9 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
COX4I2Q96KJ9 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
COX4I2Q96KJ9 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
COX4I2Q96KJ9 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
COX4I2Q96KJ9 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
COX4I2Q96KJ9 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
COX4I2Q96KJ9 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
COX4I2Q96KJ9 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
COX4I2Q96KJ9 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
COX4I2Q96KJ9 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
COX4I2Q96KJ9 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
COX4I2Q96KJ9 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
COX4I2Q96KJ9 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
COX4I2Q96KJ9 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
COX4I2Q96KJ9 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
COX4I2Q96KJ9 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
COX4I2Q96KJ9 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
COX4I2Q96KJ9 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
COX4I2Q96KJ9 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
COX4I2Q96KJ9 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
COX4I2Q96KJ9 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
COX4I2Q96KJ9 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
COX4I2Q96KJ9 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
COX4I2Q96KJ9 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
COX4I2Q96KJ9 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
COX4I2Q96KJ9 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
COX4I2Q96KJ9 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
COX4I2Q96KJ9 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
COX4I2Q96KJ9 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
COX4I2Q96KJ9 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
COX4I2Q96KJ9 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
COX4I2Q96KJ9 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
COX4I2Q96KJ9 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
COX4I2Q96KJ9 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
COX4I2Q96KJ9 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
COX4I2Q96KJ9 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
COX4I2Q96KJ9 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
COX4I2Q96KJ9 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
COX4I2Q96KJ9 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
COX4I2Q96KJ9 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
COX4I2Q96KJ9 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
COX4I2Q96KJ9 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
COX4I2Q96KJ9 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
COX4I2Q96KJ9 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
COX4I2Q96KJ9 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
COX4I2Q96KJ9 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
COX4I2Q96KJ9 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
COX4I2Q96KJ9 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
COX4I2Q96KJ9 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
COX4I2Q96KJ9 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
COX4I2Q96KJ9 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
COX4I2Q96KJ9 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
COX4I2Q96KJ9 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
COX4I2Q96KJ9 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
COX4I2Q96KJ9 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
COX4I2Q96KJ9 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
COX4I2Q96KJ9 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
COX4I2Q96KJ9 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
COX4I2Q96KJ9 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
COX4I2Q96KJ9 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
COX4I2Q96KJ9 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
COX4I2Q96KJ9 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
COX4I2Q96KJ9 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
COX4I2Q96KJ9 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
COX4I2Q96KJ9 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
COX4I2Q96KJ9 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
COX4I2Q96KJ9 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
COX4I2Q96KJ9 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
COX4I2Q96KJ9 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
COX4I2Q96KJ9 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
COX4I2Q96KJ9 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
COX4I2Q96KJ9 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
COX4I2Q96KJ9 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
COX4I2Q96KJ9 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
COX4I2Q96KJ9 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
COX4I2Q96KJ9 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
COX4I2Q96KJ9 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
COX4I2Q96KJ9 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.1 ms