Protein–RNA interactions for Protein: Q96KG9

SCYL1, N-terminal kinase-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 808 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCYL1Q96KG9 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SCYL1Q96KG9 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SCYL1Q96KG9 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SCYL1Q96KG9 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SCYL1Q96KG9 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SCYL1Q96KG9 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SCYL1Q96KG9 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SCYL1Q96KG9 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SCYL1Q96KG9 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SCYL1Q96KG9 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SCYL1Q96KG9 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SCYL1Q96KG9 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SCYL1Q96KG9 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SCYL1Q96KG9 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SCYL1Q96KG9 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SCYL1Q96KG9 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
SCYL1Q96KG9 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SCYL1Q96KG9 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SCYL1Q96KG9 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SCYL1Q96KG9 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SCYL1Q96KG9 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SCYL1Q96KG9 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
SCYL1Q96KG9 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SCYL1Q96KG9 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SCYL1Q96KG9 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SCYL1Q96KG9 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SCYL1Q96KG9 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SCYL1Q96KG9 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SCYL1Q96KG9 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SCYL1Q96KG9 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SCYL1Q96KG9 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SCYL1Q96KG9 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SCYL1Q96KG9 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SCYL1Q96KG9 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SCYL1Q96KG9 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SCYL1Q96KG9 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SCYL1Q96KG9 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SCYL1Q96KG9 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SCYL1Q96KG9 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SCYL1Q96KG9 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SCYL1Q96KG9 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
SCYL1Q96KG9 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.87
SCYL1Q96KG9 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SCYL1Q96KG9 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SCYL1Q96KG9 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SCYL1Q96KG9 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SCYL1Q96KG9 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SCYL1Q96KG9 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
SCYL1Q96KG9 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SCYL1Q96KG9 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SCYL1Q96KG9 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SCYL1Q96KG9 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SCYL1Q96KG9 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SCYL1Q96KG9 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SCYL1Q96KG9 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SCYL1Q96KG9 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
SCYL1Q96KG9 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SCYL1Q96KG9 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SCYL1Q96KG9 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SCYL1Q96KG9 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SCYL1Q96KG9 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SCYL1Q96KG9 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SCYL1Q96KG9 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SCYL1Q96KG9 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SCYL1Q96KG9 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SCYL1Q96KG9 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SCYL1Q96KG9 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SCYL1Q96KG9 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SCYL1Q96KG9 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SCYL1Q96KG9 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SCYL1Q96KG9 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SCYL1Q96KG9 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SCYL1Q96KG9 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SCYL1Q96KG9 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SCYL1Q96KG9 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SCYL1Q96KG9 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SCYL1Q96KG9 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SCYL1Q96KG9 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SCYL1Q96KG9 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SCYL1Q96KG9 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SCYL1Q96KG9 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SCYL1Q96KG9 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SCYL1Q96KG9 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SCYL1Q96KG9 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SCYL1Q96KG9 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
SCYL1Q96KG9 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SCYL1Q96KG9 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SCYL1Q96KG9 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SCYL1Q96KG9 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SCYL1Q96KG9 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SCYL1Q96KG9 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SCYL1Q96KG9 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SCYL1Q96KG9 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SCYL1Q96KG9 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
SCYL1Q96KG9 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SCYL1Q96KG9 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SCYL1Q96KG9 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SCYL1Q96KG9 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SCYL1Q96KG9 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SCYL1Q96KG9 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms