Protein–RNA interactions for Protein: Q96KA5

CLPTM1L, Cleft lip and palate transmembrane protein 1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPTM1LQ96KA5 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CLPTM1LQ96KA5 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CLPTM1LQ96KA5 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CLPTM1LQ96KA5 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CLPTM1LQ96KA5 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CLPTM1LQ96KA5 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CLPTM1LQ96KA5 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CLPTM1LQ96KA5 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CLPTM1LQ96KA5 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CLPTM1LQ96KA5 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CLPTM1LQ96KA5 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CLPTM1LQ96KA5 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CLPTM1LQ96KA5 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CLPTM1LQ96KA5 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CLPTM1LQ96KA5 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CLPTM1LQ96KA5 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CLPTM1LQ96KA5 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CLPTM1LQ96KA5 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CLPTM1LQ96KA5 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
CLPTM1LQ96KA5 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CLPTM1LQ96KA5 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CLPTM1LQ96KA5 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CLPTM1LQ96KA5 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CLPTM1LQ96KA5 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CLPTM1LQ96KA5 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CLPTM1LQ96KA5 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CLPTM1LQ96KA5 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CLPTM1LQ96KA5 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CLPTM1LQ96KA5 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CLPTM1LQ96KA5 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CLPTM1LQ96KA5 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CLPTM1LQ96KA5 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CLPTM1LQ96KA5 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CLPTM1LQ96KA5 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CLPTM1LQ96KA5 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CLPTM1LQ96KA5 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CLPTM1LQ96KA5 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CLPTM1LQ96KA5 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CLPTM1LQ96KA5 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CLPTM1LQ96KA5 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CLPTM1LQ96KA5 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CLPTM1LQ96KA5 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CLPTM1LQ96KA5 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CLPTM1LQ96KA5 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CLPTM1LQ96KA5 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CLPTM1LQ96KA5 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CLPTM1LQ96KA5 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CLPTM1LQ96KA5 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CLPTM1LQ96KA5 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CLPTM1LQ96KA5 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CLPTM1LQ96KA5 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CLPTM1LQ96KA5 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CLPTM1LQ96KA5 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CLPTM1LQ96KA5 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CLPTM1LQ96KA5 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CLPTM1LQ96KA5 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CLPTM1LQ96KA5 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CLPTM1LQ96KA5 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CLPTM1LQ96KA5 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CLPTM1LQ96KA5 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CLPTM1LQ96KA5 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CLPTM1LQ96KA5 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CLPTM1LQ96KA5 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CLPTM1LQ96KA5 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CLPTM1LQ96KA5 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CLPTM1LQ96KA5 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CLPTM1LQ96KA5 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
CLPTM1LQ96KA5 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CLPTM1LQ96KA5 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CLPTM1LQ96KA5 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CLPTM1LQ96KA5 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CLPTM1LQ96KA5 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CLPTM1LQ96KA5 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CLPTM1LQ96KA5 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CLPTM1LQ96KA5 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CLPTM1LQ96KA5 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CLPTM1LQ96KA5 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CLPTM1LQ96KA5 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CLPTM1LQ96KA5 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CLPTM1LQ96KA5 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CLPTM1LQ96KA5 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CLPTM1LQ96KA5 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CLPTM1LQ96KA5 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CLPTM1LQ96KA5 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CLPTM1LQ96KA5 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLPTM1LQ96KA5 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLPTM1LQ96KA5 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CLPTM1LQ96KA5 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CLPTM1LQ96KA5 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CLPTM1LQ96KA5 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CLPTM1LQ96KA5 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CLPTM1LQ96KA5 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CLPTM1LQ96KA5 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CLPTM1LQ96KA5 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CLPTM1LQ96KA5 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CLPTM1LQ96KA5 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
CLPTM1LQ96KA5 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CLPTM1LQ96KA5 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CLPTM1LQ96KA5 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CLPTM1LQ96KA5 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms