Protein–RNA interactions for Protein: Q96J65

ABCC12, Multidrug resistance-associated protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC12Q96J65 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
ABCC12Q96J65 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
ABCC12Q96J65 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC34.37■■■■□ 3.09
ABCC12Q96J65 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.36■■■■□ 3.09
ABCC12Q96J65 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
ABCC12Q96J65 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
ABCC12Q96J65 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC34.35■■■■□ 3.09
ABCC12Q96J65 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
ABCC12Q96J65 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
ABCC12Q96J65 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
ABCC12Q96J65 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC34.33■■■■□ 3.09
ABCC12Q96J65 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
ABCC12Q96J65 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
ABCC12Q96J65 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
ABCC12Q96J65 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
ABCC12Q96J65 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
ABCC12Q96J65 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
ABCC12Q96J65 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
ABCC12Q96J65 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
ABCC12Q96J65 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
ABCC12Q96J65 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
ABCC12Q96J65 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
ABCC12Q96J65 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC34.22■■■■□ 3.07
ABCC12Q96J65 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC34.22■■■■□ 3.07
ABCC12Q96J65 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
ABCC12Q96J65 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
ABCC12Q96J65 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
ABCC12Q96J65 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
ABCC12Q96J65 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
ABCC12Q96J65 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
ABCC12Q96J65 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
ABCC12Q96J65 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
ABCC12Q96J65 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC34.17■■■■□ 3.06
ABCC12Q96J65 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
ABCC12Q96J65 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
ABCC12Q96J65 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
ABCC12Q96J65 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
ABCC12Q96J65 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
ABCC12Q96J65 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
ABCC12Q96J65 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
ABCC12Q96J65 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
ABCC12Q96J65 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
ABCC12Q96J65 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
ABCC12Q96J65 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC34.13■■■■□ 3.05
ABCC12Q96J65 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
ABCC12Q96J65 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
ABCC12Q96J65 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
ABCC12Q96J65 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
ABCC12Q96J65 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
ABCC12Q96J65 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
ABCC12Q96J65 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
ABCC12Q96J65 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
ABCC12Q96J65 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
ABCC12Q96J65 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC34.07■■■■□ 3.04
ABCC12Q96J65 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC34.06■■■■□ 3.04
ABCC12Q96J65 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC34.06■■■■□ 3.04
ABCC12Q96J65 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
ABCC12Q96J65 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC34.05■■■■□ 3.04
ABCC12Q96J65 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
ABCC12Q96J65 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
ABCC12Q96J65 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
ABCC12Q96J65 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
ABCC12Q96J65 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
ABCC12Q96J65 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.04
ABCC12Q96J65 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
ABCC12Q96J65 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
ABCC12Q96J65 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
ABCC12Q96J65 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
ABCC12Q96J65 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
ABCC12Q96J65 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
ABCC12Q96J65 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
ABCC12Q96J65 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
ABCC12Q96J65 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
ABCC12Q96J65 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
ABCC12Q96J65 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
ABCC12Q96J65 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
ABCC12Q96J65 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
ABCC12Q96J65 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC33.91■■■■□ 3.02
ABCC12Q96J65 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
ABCC12Q96J65 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
ABCC12Q96J65 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
ABCC12Q96J65 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
ABCC12Q96J65 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
ABCC12Q96J65 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
ABCC12Q96J65 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
ABCC12Q96J65 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
ABCC12Q96J65 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
ABCC12Q96J65 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
ABCC12Q96J65 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
ABCC12Q96J65 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
ABCC12Q96J65 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
ABCC12Q96J65 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
ABCC12Q96J65 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
ABCC12Q96J65 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC33.86■■■■□ 3.01
ABCC12Q96J65 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
ABCC12Q96J65 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
ABCC12Q96J65 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
ABCC12Q96J65 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
ABCC12Q96J65 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC33.8■■■■□ 3
ABCC12Q96J65 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.8 ms