Protein–RNA interactions for Protein: Q96IF1

AJUBA, LIM domain-containing protein ajuba, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AJUBAQ96IF1 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AJUBAQ96IF1 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AJUBAQ96IF1 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22■■□□□ 1.11
AJUBAQ96IF1 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AJUBAQ96IF1 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AJUBAQ96IF1 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AJUBAQ96IF1 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
AJUBAQ96IF1 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AJUBAQ96IF1 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AJUBAQ96IF1 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AJUBAQ96IF1 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
AJUBAQ96IF1 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
AJUBAQ96IF1 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
AJUBAQ96IF1 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
AJUBAQ96IF1 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
AJUBAQ96IF1 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
AJUBAQ96IF1 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
AJUBAQ96IF1 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
AJUBAQ96IF1 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
AJUBAQ96IF1 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
AJUBAQ96IF1 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
AJUBAQ96IF1 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
AJUBAQ96IF1 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
AJUBAQ96IF1 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
AJUBAQ96IF1 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
AJUBAQ96IF1 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
AJUBAQ96IF1 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
AJUBAQ96IF1 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
AJUBAQ96IF1 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
AJUBAQ96IF1 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
AJUBAQ96IF1 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
AJUBAQ96IF1 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
AJUBAQ96IF1 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
AJUBAQ96IF1 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
AJUBAQ96IF1 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
AJUBAQ96IF1 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
AJUBAQ96IF1 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
AJUBAQ96IF1 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
AJUBAQ96IF1 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
AJUBAQ96IF1 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
AJUBAQ96IF1 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
AJUBAQ96IF1 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
AJUBAQ96IF1 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
AJUBAQ96IF1 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
AJUBAQ96IF1 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
AJUBAQ96IF1 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
AJUBAQ96IF1 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
AJUBAQ96IF1 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
AJUBAQ96IF1 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
AJUBAQ96IF1 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
AJUBAQ96IF1 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
AJUBAQ96IF1 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
AJUBAQ96IF1 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
AJUBAQ96IF1 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
AJUBAQ96IF1 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
AJUBAQ96IF1 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
AJUBAQ96IF1 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
AJUBAQ96IF1 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
AJUBAQ96IF1 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
AJUBAQ96IF1 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
AJUBAQ96IF1 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
AJUBAQ96IF1 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
AJUBAQ96IF1 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
AJUBAQ96IF1 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
AJUBAQ96IF1 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
AJUBAQ96IF1 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
AJUBAQ96IF1 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
AJUBAQ96IF1 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
AJUBAQ96IF1 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
AJUBAQ96IF1 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
AJUBAQ96IF1 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
AJUBAQ96IF1 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
AJUBAQ96IF1 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
AJUBAQ96IF1 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
AJUBAQ96IF1 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
AJUBAQ96IF1 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
AJUBAQ96IF1 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
AJUBAQ96IF1 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
AJUBAQ96IF1 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
AJUBAQ96IF1 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
AJUBAQ96IF1 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
AJUBAQ96IF1 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
AJUBAQ96IF1 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
AJUBAQ96IF1 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
AJUBAQ96IF1 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
AJUBAQ96IF1 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
AJUBAQ96IF1 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
AJUBAQ96IF1 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
AJUBAQ96IF1 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
AJUBAQ96IF1 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
AJUBAQ96IF1 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
AJUBAQ96IF1 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
AJUBAQ96IF1 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
AJUBAQ96IF1 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
AJUBAQ96IF1 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
AJUBAQ96IF1 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
AJUBAQ96IF1 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
AJUBAQ96IF1 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
AJUBAQ96IF1 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
AJUBAQ96IF1 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
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