Protein–RNA interactions for Protein: Q96H96

COQ2, 4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COQ2Q96H96 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
COQ2Q96H96 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
COQ2Q96H96 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
COQ2Q96H96 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
COQ2Q96H96 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
COQ2Q96H96 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
COQ2Q96H96 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
COQ2Q96H96 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
COQ2Q96H96 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
COQ2Q96H96 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
COQ2Q96H96 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
COQ2Q96H96 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COQ2Q96H96 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
COQ2Q96H96 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
COQ2Q96H96 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
COQ2Q96H96 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
COQ2Q96H96 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
COQ2Q96H96 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
COQ2Q96H96 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
COQ2Q96H96 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
COQ2Q96H96 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
COQ2Q96H96 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
COQ2Q96H96 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
COQ2Q96H96 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
COQ2Q96H96 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
COQ2Q96H96 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
COQ2Q96H96 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
COQ2Q96H96 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
COQ2Q96H96 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
COQ2Q96H96 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
COQ2Q96H96 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
COQ2Q96H96 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
COQ2Q96H96 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
COQ2Q96H96 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
COQ2Q96H96 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
COQ2Q96H96 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
COQ2Q96H96 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
COQ2Q96H96 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
COQ2Q96H96 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
COQ2Q96H96 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
COQ2Q96H96 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
COQ2Q96H96 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
COQ2Q96H96 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
COQ2Q96H96 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
COQ2Q96H96 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
COQ2Q96H96 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
COQ2Q96H96 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
COQ2Q96H96 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
COQ2Q96H96 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
COQ2Q96H96 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
COQ2Q96H96 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
COQ2Q96H96 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
COQ2Q96H96 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COQ2Q96H96 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
COQ2Q96H96 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
COQ2Q96H96 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COQ2Q96H96 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COQ2Q96H96 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COQ2Q96H96 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COQ2Q96H96 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
COQ2Q96H96 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COQ2Q96H96 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COQ2Q96H96 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
COQ2Q96H96 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
COQ2Q96H96 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
COQ2Q96H96 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
COQ2Q96H96 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COQ2Q96H96 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COQ2Q96H96 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
COQ2Q96H96 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
COQ2Q96H96 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COQ2Q96H96 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COQ2Q96H96 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
COQ2Q96H96 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
COQ2Q96H96 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
COQ2Q96H96 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
COQ2Q96H96 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
COQ2Q96H96 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
COQ2Q96H96 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
COQ2Q96H96 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
COQ2Q96H96 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
COQ2Q96H96 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
COQ2Q96H96 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
COQ2Q96H96 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
COQ2Q96H96 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
COQ2Q96H96 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
COQ2Q96H96 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
COQ2Q96H96 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
COQ2Q96H96 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
COQ2Q96H96 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
COQ2Q96H96 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
COQ2Q96H96 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COQ2Q96H96 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COQ2Q96H96 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
COQ2Q96H96 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COQ2Q96H96 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COQ2Q96H96 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
COQ2Q96H96 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COQ2Q96H96 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COQ2Q96H96 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms