Protein–RNA interactions for Protein: Q96F86

EDC3, Enhancer of mRNA-decapping protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDC3Q96F86 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
EDC3Q96F86 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
EDC3Q96F86 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.11■■■□□ 2.89
EDC3Q96F86 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
EDC3Q96F86 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
EDC3Q96F86 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
EDC3Q96F86 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC33.08■■■□□ 2.89
EDC3Q96F86 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
EDC3Q96F86 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
EDC3Q96F86 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
EDC3Q96F86 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC33.07■■■□□ 2.88
EDC3Q96F86 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
EDC3Q96F86 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
EDC3Q96F86 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC33.05■■■□□ 2.88
EDC3Q96F86 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
EDC3Q96F86 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
EDC3Q96F86 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
EDC3Q96F86 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC33.03■■■□□ 2.88
EDC3Q96F86 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
EDC3Q96F86 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
EDC3Q96F86 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
EDC3Q96F86 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
EDC3Q96F86 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
EDC3Q96F86 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.87
EDC3Q96F86 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
EDC3Q96F86 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
EDC3Q96F86 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
EDC3Q96F86 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
EDC3Q96F86 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC32.96■■■□□ 2.87
EDC3Q96F86 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
EDC3Q96F86 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
EDC3Q96F86 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
EDC3Q96F86 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
EDC3Q96F86 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
EDC3Q96F86 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
EDC3Q96F86 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
EDC3Q96F86 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
EDC3Q96F86 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
EDC3Q96F86 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
EDC3Q96F86 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
EDC3Q96F86 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
EDC3Q96F86 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
EDC3Q96F86 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
EDC3Q96F86 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
EDC3Q96F86 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
EDC3Q96F86 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC32.82■■■□□ 2.85
EDC3Q96F86 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.84
EDC3Q96F86 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC32.82■■■□□ 2.84
EDC3Q96F86 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
EDC3Q96F86 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.81■■■□□ 2.84
EDC3Q96F86 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
EDC3Q96F86 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
EDC3Q96F86 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
EDC3Q96F86 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
EDC3Q96F86 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
EDC3Q96F86 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
EDC3Q96F86 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
EDC3Q96F86 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
EDC3Q96F86 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
EDC3Q96F86 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
EDC3Q96F86 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.83
EDC3Q96F86 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC32.7■■■□□ 2.83
EDC3Q96F86 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
EDC3Q96F86 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
EDC3Q96F86 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
EDC3Q96F86 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
EDC3Q96F86 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
EDC3Q96F86 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC32.67■■■□□ 2.82
EDC3Q96F86 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
EDC3Q96F86 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
EDC3Q96F86 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC32.66■■■□□ 2.82
EDC3Q96F86 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
EDC3Q96F86 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC32.64■■■□□ 2.82
EDC3Q96F86 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
EDC3Q96F86 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
EDC3Q96F86 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
EDC3Q96F86 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
EDC3Q96F86 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
EDC3Q96F86 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
EDC3Q96F86 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
EDC3Q96F86 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
EDC3Q96F86 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
EDC3Q96F86 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
EDC3Q96F86 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
EDC3Q96F86 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
EDC3Q96F86 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
EDC3Q96F86 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC32.59■■■□□ 2.81
EDC3Q96F86 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
EDC3Q96F86 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
EDC3Q96F86 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
EDC3Q96F86 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
EDC3Q96F86 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
EDC3Q96F86 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
EDC3Q96F86 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
EDC3Q96F86 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
EDC3Q96F86 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC32.56■■■□□ 2.8
EDC3Q96F86 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
EDC3Q96F86 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
EDC3Q96F86 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
EDC3Q96F86 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC32.55■■■□□ 2.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms