Protein–RNA interactions for Protein: Q96F07

CYFIP2, Cytoplasmic FMR1-interacting protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYFIP2Q96F07 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
CYFIP2Q96F07 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CYFIP2Q96F07 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CYFIP2Q96F07 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CYFIP2Q96F07 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CYFIP2Q96F07 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
CYFIP2Q96F07 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CYFIP2Q96F07 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CYFIP2Q96F07 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CYFIP2Q96F07 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CYFIP2Q96F07 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
CYFIP2Q96F07 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CYFIP2Q96F07 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CYFIP2Q96F07 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CYFIP2Q96F07 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CYFIP2Q96F07 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CYFIP2Q96F07 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CYFIP2Q96F07 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CYFIP2Q96F07 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CYFIP2Q96F07 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CYFIP2Q96F07 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CYFIP2Q96F07 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CYFIP2Q96F07 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CYFIP2Q96F07 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CYFIP2Q96F07 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CYFIP2Q96F07 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CYFIP2Q96F07 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CYFIP2Q96F07 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CYFIP2Q96F07 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CYFIP2Q96F07 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CYFIP2Q96F07 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CYFIP2Q96F07 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CYFIP2Q96F07 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CYFIP2Q96F07 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CYFIP2Q96F07 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CYFIP2Q96F07 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
CYFIP2Q96F07 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CYFIP2Q96F07 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
CYFIP2Q96F07 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
CYFIP2Q96F07 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CYFIP2Q96F07 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CYFIP2Q96F07 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
CYFIP2Q96F07 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CYFIP2Q96F07 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CYFIP2Q96F07 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CYFIP2Q96F07 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CYFIP2Q96F07 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CYFIP2Q96F07 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CYFIP2Q96F07 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
CYFIP2Q96F07 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CYFIP2Q96F07 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CYFIP2Q96F07 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CYFIP2Q96F07 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
CYFIP2Q96F07 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
CYFIP2Q96F07 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CYFIP2Q96F07 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CYFIP2Q96F07 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CYFIP2Q96F07 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CYFIP2Q96F07 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
CYFIP2Q96F07 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CYFIP2Q96F07 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CYFIP2Q96F07 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CYFIP2Q96F07 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CYFIP2Q96F07 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CYFIP2Q96F07 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CYFIP2Q96F07 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CYFIP2Q96F07 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CYFIP2Q96F07 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CYFIP2Q96F07 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CYFIP2Q96F07 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CYFIP2Q96F07 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CYFIP2Q96F07 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CYFIP2Q96F07 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CYFIP2Q96F07 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CYFIP2Q96F07 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CYFIP2Q96F07 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CYFIP2Q96F07 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CYFIP2Q96F07 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CYFIP2Q96F07 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CYFIP2Q96F07 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CYFIP2Q96F07 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CYFIP2Q96F07 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CYFIP2Q96F07 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CYFIP2Q96F07 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CYFIP2Q96F07 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CYFIP2Q96F07 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CYFIP2Q96F07 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CYFIP2Q96F07 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CYFIP2Q96F07 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CYFIP2Q96F07 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
CYFIP2Q96F07 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CYFIP2Q96F07 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CYFIP2Q96F07 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CYFIP2Q96F07 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CYFIP2Q96F07 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CYFIP2Q96F07 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CYFIP2Q96F07 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CYFIP2Q96F07 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CYFIP2Q96F07 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CYFIP2Q96F07 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms