Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES7

SGF29, SAGA-associated factor 29, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGF29Q96ES7 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SGF29Q96ES7 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SGF29Q96ES7 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
SGF29Q96ES7 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SGF29Q96ES7 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SGF29Q96ES7 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SGF29Q96ES7 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SGF29Q96ES7 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SGF29Q96ES7 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SGF29Q96ES7 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
SGF29Q96ES7 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SGF29Q96ES7 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
SGF29Q96ES7 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SGF29Q96ES7 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SGF29Q96ES7 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SGF29Q96ES7 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SGF29Q96ES7 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SGF29Q96ES7 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SGF29Q96ES7 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SGF29Q96ES7 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SGF29Q96ES7 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SGF29Q96ES7 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SGF29Q96ES7 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SGF29Q96ES7 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SGF29Q96ES7 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SGF29Q96ES7 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SGF29Q96ES7 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SGF29Q96ES7 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SGF29Q96ES7 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
SGF29Q96ES7 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
SGF29Q96ES7 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SGF29Q96ES7 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SGF29Q96ES7 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SGF29Q96ES7 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SGF29Q96ES7 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
SGF29Q96ES7 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SGF29Q96ES7 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
SGF29Q96ES7 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SGF29Q96ES7 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SGF29Q96ES7 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SGF29Q96ES7 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SGF29Q96ES7 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SGF29Q96ES7 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SGF29Q96ES7 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SGF29Q96ES7 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
SGF29Q96ES7 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SGF29Q96ES7 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SGF29Q96ES7 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SGF29Q96ES7 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SGF29Q96ES7 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SGF29Q96ES7 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SGF29Q96ES7 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SGF29Q96ES7 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SGF29Q96ES7 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
SGF29Q96ES7 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SGF29Q96ES7 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SGF29Q96ES7 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SGF29Q96ES7 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SGF29Q96ES7 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SGF29Q96ES7 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SGF29Q96ES7 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SGF29Q96ES7 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SGF29Q96ES7 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SGF29Q96ES7 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SGF29Q96ES7 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
SGF29Q96ES7 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SGF29Q96ES7 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SGF29Q96ES7 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SGF29Q96ES7 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SGF29Q96ES7 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SGF29Q96ES7 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
SGF29Q96ES7 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
SGF29Q96ES7 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SGF29Q96ES7 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SGF29Q96ES7 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SGF29Q96ES7 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SGF29Q96ES7 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
SGF29Q96ES7 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SGF29Q96ES7 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SGF29Q96ES7 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
SGF29Q96ES7 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SGF29Q96ES7 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SGF29Q96ES7 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SGF29Q96ES7 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SGF29Q96ES7 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SGF29Q96ES7 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SGF29Q96ES7 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SGF29Q96ES7 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SGF29Q96ES7 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SGF29Q96ES7 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SGF29Q96ES7 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SGF29Q96ES7 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SGF29Q96ES7 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SGF29Q96ES7 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SGF29Q96ES7 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SGF29Q96ES7 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SGF29Q96ES7 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SGF29Q96ES7 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SGF29Q96ES7 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SGF29Q96ES7 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms