Protein–RNA interactions for Protein: Q96EL3

MRPL53, 39S ribosomal protein L53, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL53Q96EL3 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MRPL53Q96EL3 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MRPL53Q96EL3 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MRPL53Q96EL3 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MRPL53Q96EL3 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
MRPL53Q96EL3 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MRPL53Q96EL3 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
MRPL53Q96EL3 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MRPL53Q96EL3 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MRPL53Q96EL3 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MRPL53Q96EL3 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MRPL53Q96EL3 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MRPL53Q96EL3 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
MRPL53Q96EL3 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
MRPL53Q96EL3 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
MRPL53Q96EL3 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MRPL53Q96EL3 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MRPL53Q96EL3 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MRPL53Q96EL3 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MRPL53Q96EL3 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MRPL53Q96EL3 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MRPL53Q96EL3 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
MRPL53Q96EL3 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MRPL53Q96EL3 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
MRPL53Q96EL3 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MRPL53Q96EL3 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
MRPL53Q96EL3 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MRPL53Q96EL3 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MRPL53Q96EL3 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
MRPL53Q96EL3 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
MRPL53Q96EL3 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MRPL53Q96EL3 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
MRPL53Q96EL3 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MRPL53Q96EL3 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MRPL53Q96EL3 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MRPL53Q96EL3 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MRPL53Q96EL3 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MRPL53Q96EL3 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MRPL53Q96EL3 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MRPL53Q96EL3 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MRPL53Q96EL3 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MRPL53Q96EL3 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MRPL53Q96EL3 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MRPL53Q96EL3 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MRPL53Q96EL3 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MRPL53Q96EL3 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MRPL53Q96EL3 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
MRPL53Q96EL3 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MRPL53Q96EL3 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MRPL53Q96EL3 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MRPL53Q96EL3 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
MRPL53Q96EL3 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MRPL53Q96EL3 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MRPL53Q96EL3 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MRPL53Q96EL3 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MRPL53Q96EL3 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MRPL53Q96EL3 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MRPL53Q96EL3 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MRPL53Q96EL3 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MRPL53Q96EL3 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MRPL53Q96EL3 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
MRPL53Q96EL3 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MRPL53Q96EL3 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MRPL53Q96EL3 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MRPL53Q96EL3 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MRPL53Q96EL3 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MRPL53Q96EL3 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MRPL53Q96EL3 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MRPL53Q96EL3 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MRPL53Q96EL3 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MRPL53Q96EL3 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MRPL53Q96EL3 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MRPL53Q96EL3 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MRPL53Q96EL3 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MRPL53Q96EL3 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MRPL53Q96EL3 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MRPL53Q96EL3 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MRPL53Q96EL3 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MRPL53Q96EL3 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MRPL53Q96EL3 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MRPL53Q96EL3 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MRPL53Q96EL3 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MRPL53Q96EL3 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MRPL53Q96EL3 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MRPL53Q96EL3 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MRPL53Q96EL3 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MRPL53Q96EL3 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MRPL53Q96EL3 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MRPL53Q96EL3 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MRPL53Q96EL3 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MRPL53Q96EL3 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
MRPL53Q96EL3 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
MRPL53Q96EL3 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MRPL53Q96EL3 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MRPL53Q96EL3 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MRPL53Q96EL3 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MRPL53Q96EL3 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MRPL53Q96EL3 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MRPL53Q96EL3 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MRPL53Q96EL3 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.5 ms