Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM3

C18orf8, Uncharacterized protein C18orf8, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf8Q96DM3 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
C18orf8Q96DM3 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
C18orf8Q96DM3 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
C18orf8Q96DM3 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
C18orf8Q96DM3 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
C18orf8Q96DM3 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
C18orf8Q96DM3 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
C18orf8Q96DM3 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
C18orf8Q96DM3 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
C18orf8Q96DM3 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
C18orf8Q96DM3 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
C18orf8Q96DM3 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
C18orf8Q96DM3 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
C18orf8Q96DM3 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
C18orf8Q96DM3 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
C18orf8Q96DM3 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
C18orf8Q96DM3 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC28.74■■■□□ 2.19
C18orf8Q96DM3 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
C18orf8Q96DM3 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
C18orf8Q96DM3 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
C18orf8Q96DM3 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
C18orf8Q96DM3 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.19
C18orf8Q96DM3 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
C18orf8Q96DM3 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
C18orf8Q96DM3 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
C18orf8Q96DM3 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
C18orf8Q96DM3 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
C18orf8Q96DM3 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
C18orf8Q96DM3 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
C18orf8Q96DM3 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
C18orf8Q96DM3 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
C18orf8Q96DM3 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
C18orf8Q96DM3 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
C18orf8Q96DM3 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
C18orf8Q96DM3 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
C18orf8Q96DM3 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
C18orf8Q96DM3 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
C18orf8Q96DM3 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
C18orf8Q96DM3 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
C18orf8Q96DM3 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
C18orf8Q96DM3 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
C18orf8Q96DM3 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
C18orf8Q96DM3 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
C18orf8Q96DM3 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
C18orf8Q96DM3 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
C18orf8Q96DM3 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
C18orf8Q96DM3 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
C18orf8Q96DM3 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
C18orf8Q96DM3 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
C18orf8Q96DM3 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
C18orf8Q96DM3 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
C18orf8Q96DM3 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
C18orf8Q96DM3 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
C18orf8Q96DM3 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
C18orf8Q96DM3 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
C18orf8Q96DM3 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
C18orf8Q96DM3 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
C18orf8Q96DM3 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
C18orf8Q96DM3 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
C18orf8Q96DM3 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
C18orf8Q96DM3 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
C18orf8Q96DM3 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
C18orf8Q96DM3 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
C18orf8Q96DM3 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
C18orf8Q96DM3 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
C18orf8Q96DM3 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
C18orf8Q96DM3 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
C18orf8Q96DM3 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
C18orf8Q96DM3 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
C18orf8Q96DM3 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
C18orf8Q96DM3 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
C18orf8Q96DM3 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
C18orf8Q96DM3 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
C18orf8Q96DM3 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
C18orf8Q96DM3 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
C18orf8Q96DM3 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
C18orf8Q96DM3 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
C18orf8Q96DM3 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
C18orf8Q96DM3 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
C18orf8Q96DM3 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
C18orf8Q96DM3 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
C18orf8Q96DM3 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
C18orf8Q96DM3 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
C18orf8Q96DM3 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
C18orf8Q96DM3 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
C18orf8Q96DM3 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
C18orf8Q96DM3 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
C18orf8Q96DM3 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
C18orf8Q96DM3 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
C18orf8Q96DM3 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
C18orf8Q96DM3 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
C18orf8Q96DM3 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
C18orf8Q96DM3 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.12
C18orf8Q96DM3 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
C18orf8Q96DM3 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
C18orf8Q96DM3 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
C18orf8Q96DM3 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
C18orf8Q96DM3 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
C18orf8Q96DM3 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
C18orf8Q96DM3 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms