Protein–RNA interactions for Protein: Q96DB5

RMDN1, Regulator of microtubule dynamics protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RMDN1Q96DB5 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RMDN1Q96DB5 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RMDN1Q96DB5 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RMDN1Q96DB5 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RMDN1Q96DB5 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RMDN1Q96DB5 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RMDN1Q96DB5 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RMDN1Q96DB5 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RMDN1Q96DB5 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RMDN1Q96DB5 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RMDN1Q96DB5 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RMDN1Q96DB5 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
RMDN1Q96DB5 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RMDN1Q96DB5 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RMDN1Q96DB5 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RMDN1Q96DB5 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RMDN1Q96DB5 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RMDN1Q96DB5 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RMDN1Q96DB5 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RMDN1Q96DB5 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RMDN1Q96DB5 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RMDN1Q96DB5 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RMDN1Q96DB5 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
RMDN1Q96DB5 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
RMDN1Q96DB5 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RMDN1Q96DB5 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
RMDN1Q96DB5 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RMDN1Q96DB5 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RMDN1Q96DB5 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
RMDN1Q96DB5 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RMDN1Q96DB5 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RMDN1Q96DB5 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RMDN1Q96DB5 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RMDN1Q96DB5 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RMDN1Q96DB5 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RMDN1Q96DB5 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RMDN1Q96DB5 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RMDN1Q96DB5 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RMDN1Q96DB5 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RMDN1Q96DB5 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RMDN1Q96DB5 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RMDN1Q96DB5 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RMDN1Q96DB5 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RMDN1Q96DB5 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RMDN1Q96DB5 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RMDN1Q96DB5 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
RMDN1Q96DB5 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RMDN1Q96DB5 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
RMDN1Q96DB5 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RMDN1Q96DB5 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RMDN1Q96DB5 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RMDN1Q96DB5 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RMDN1Q96DB5 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RMDN1Q96DB5 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
RMDN1Q96DB5 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RMDN1Q96DB5 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
RMDN1Q96DB5 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RMDN1Q96DB5 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
RMDN1Q96DB5 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RMDN1Q96DB5 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
RMDN1Q96DB5 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RMDN1Q96DB5 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RMDN1Q96DB5 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RMDN1Q96DB5 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RMDN1Q96DB5 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RMDN1Q96DB5 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RMDN1Q96DB5 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RMDN1Q96DB5 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RMDN1Q96DB5 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
RMDN1Q96DB5 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RMDN1Q96DB5 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RMDN1Q96DB5 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RMDN1Q96DB5 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RMDN1Q96DB5 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RMDN1Q96DB5 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RMDN1Q96DB5 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
RMDN1Q96DB5 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
RMDN1Q96DB5 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.64■■■□□ 2.02
RMDN1Q96DB5 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RMDN1Q96DB5 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RMDN1Q96DB5 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RMDN1Q96DB5 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RMDN1Q96DB5 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RMDN1Q96DB5 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
RMDN1Q96DB5 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RMDN1Q96DB5 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RMDN1Q96DB5 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
RMDN1Q96DB5 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RMDN1Q96DB5 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RMDN1Q96DB5 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RMDN1Q96DB5 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RMDN1Q96DB5 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RMDN1Q96DB5 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RMDN1Q96DB5 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RMDN1Q96DB5 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RMDN1Q96DB5 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RMDN1Q96DB5 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RMDN1Q96DB5 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RMDN1Q96DB5 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RMDN1Q96DB5 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms