Protein–RNA interactions for Protein: Q96DB2

HDAC11, Histone deacetylase 11, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC11Q96DB2 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
HDAC11Q96DB2 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
HDAC11Q96DB2 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
HDAC11Q96DB2 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
HDAC11Q96DB2 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.85■■■□□ 2.05
HDAC11Q96DB2 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
HDAC11Q96DB2 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
HDAC11Q96DB2 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
HDAC11Q96DB2 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
HDAC11Q96DB2 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
HDAC11Q96DB2 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
HDAC11Q96DB2 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
HDAC11Q96DB2 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
HDAC11Q96DB2 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
HDAC11Q96DB2 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
HDAC11Q96DB2 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
HDAC11Q96DB2 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
HDAC11Q96DB2 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
HDAC11Q96DB2 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
HDAC11Q96DB2 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
HDAC11Q96DB2 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
HDAC11Q96DB2 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
HDAC11Q96DB2 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
HDAC11Q96DB2 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
HDAC11Q96DB2 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
HDAC11Q96DB2 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
HDAC11Q96DB2 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
HDAC11Q96DB2 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
HDAC11Q96DB2 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
HDAC11Q96DB2 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
HDAC11Q96DB2 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
HDAC11Q96DB2 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
HDAC11Q96DB2 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
HDAC11Q96DB2 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
HDAC11Q96DB2 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
HDAC11Q96DB2 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
HDAC11Q96DB2 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
HDAC11Q96DB2 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
HDAC11Q96DB2 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
HDAC11Q96DB2 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
HDAC11Q96DB2 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
HDAC11Q96DB2 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
HDAC11Q96DB2 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
HDAC11Q96DB2 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
HDAC11Q96DB2 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
HDAC11Q96DB2 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
HDAC11Q96DB2 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
HDAC11Q96DB2 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
HDAC11Q96DB2 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
HDAC11Q96DB2 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
HDAC11Q96DB2 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
HDAC11Q96DB2 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
HDAC11Q96DB2 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
HDAC11Q96DB2 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.55■■■□□ 2
HDAC11Q96DB2 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
HDAC11Q96DB2 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
HDAC11Q96DB2 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
HDAC11Q96DB2 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
HDAC11Q96DB2 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
HDAC11Q96DB2 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
HDAC11Q96DB2 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
HDAC11Q96DB2 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
HDAC11Q96DB2 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
HDAC11Q96DB2 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
HDAC11Q96DB2 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
HDAC11Q96DB2 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
HDAC11Q96DB2 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
HDAC11Q96DB2 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
HDAC11Q96DB2 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
HDAC11Q96DB2 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
HDAC11Q96DB2 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
HDAC11Q96DB2 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
HDAC11Q96DB2 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
HDAC11Q96DB2 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
HDAC11Q96DB2 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
HDAC11Q96DB2 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
HDAC11Q96DB2 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
HDAC11Q96DB2 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
HDAC11Q96DB2 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
HDAC11Q96DB2 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
HDAC11Q96DB2 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
HDAC11Q96DB2 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
HDAC11Q96DB2 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
HDAC11Q96DB2 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
HDAC11Q96DB2 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
HDAC11Q96DB2 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
HDAC11Q96DB2 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
HDAC11Q96DB2 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
HDAC11Q96DB2 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
HDAC11Q96DB2 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
HDAC11Q96DB2 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
HDAC11Q96DB2 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
HDAC11Q96DB2 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
HDAC11Q96DB2 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
HDAC11Q96DB2 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
HDAC11Q96DB2 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
HDAC11Q96DB2 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
HDAC11Q96DB2 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
HDAC11Q96DB2 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
HDAC11Q96DB2 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122.6 ms