Protein–RNA interactions for Protein: Q96CT2

KLHL29, Kelch-like protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL29Q96CT2 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
KLHL29Q96CT2 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
KLHL29Q96CT2 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
KLHL29Q96CT2 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
KLHL29Q96CT2 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
KLHL29Q96CT2 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
KLHL29Q96CT2 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
KLHL29Q96CT2 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
KLHL29Q96CT2 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
KLHL29Q96CT2 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
KLHL29Q96CT2 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
KLHL29Q96CT2 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
KLHL29Q96CT2 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
KLHL29Q96CT2 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
KLHL29Q96CT2 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
KLHL29Q96CT2 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
KLHL29Q96CT2 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
KLHL29Q96CT2 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
KLHL29Q96CT2 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
KLHL29Q96CT2 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
KLHL29Q96CT2 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
KLHL29Q96CT2 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
KLHL29Q96CT2 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
KLHL29Q96CT2 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
KLHL29Q96CT2 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
KLHL29Q96CT2 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
KLHL29Q96CT2 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
KLHL29Q96CT2 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
KLHL29Q96CT2 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
KLHL29Q96CT2 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
KLHL29Q96CT2 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
KLHL29Q96CT2 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
KLHL29Q96CT2 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
KLHL29Q96CT2 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
KLHL29Q96CT2 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
KLHL29Q96CT2 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
KLHL29Q96CT2 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
KLHL29Q96CT2 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
KLHL29Q96CT2 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
KLHL29Q96CT2 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
KLHL29Q96CT2 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
KLHL29Q96CT2 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
KLHL29Q96CT2 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
KLHL29Q96CT2 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
KLHL29Q96CT2 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
KLHL29Q96CT2 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
KLHL29Q96CT2 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
KLHL29Q96CT2 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
KLHL29Q96CT2 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
KLHL29Q96CT2 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
KLHL29Q96CT2 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
KLHL29Q96CT2 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
KLHL29Q96CT2 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
KLHL29Q96CT2 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
KLHL29Q96CT2 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
KLHL29Q96CT2 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
KLHL29Q96CT2 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
KLHL29Q96CT2 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
KLHL29Q96CT2 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
KLHL29Q96CT2 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
KLHL29Q96CT2 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
KLHL29Q96CT2 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
KLHL29Q96CT2 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
KLHL29Q96CT2 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
KLHL29Q96CT2 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
KLHL29Q96CT2 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
KLHL29Q96CT2 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
KLHL29Q96CT2 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
KLHL29Q96CT2 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
KLHL29Q96CT2 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
KLHL29Q96CT2 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
KLHL29Q96CT2 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
KLHL29Q96CT2 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
KLHL29Q96CT2 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
KLHL29Q96CT2 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
KLHL29Q96CT2 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
KLHL29Q96CT2 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
KLHL29Q96CT2 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
KLHL29Q96CT2 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
KLHL29Q96CT2 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
KLHL29Q96CT2 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
KLHL29Q96CT2 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
KLHL29Q96CT2 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
KLHL29Q96CT2 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
KLHL29Q96CT2 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
KLHL29Q96CT2 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
KLHL29Q96CT2 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.84
KLHL29Q96CT2 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
KLHL29Q96CT2 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
KLHL29Q96CT2 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
KLHL29Q96CT2 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
KLHL29Q96CT2 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
KLHL29Q96CT2 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
KLHL29Q96CT2 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
KLHL29Q96CT2 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
KLHL29Q96CT2 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
KLHL29Q96CT2 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
KLHL29Q96CT2 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
KLHL29Q96CT2 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
KLHL29Q96CT2 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 184.4 ms