Protein–RNA interactions for Protein: Q96CN5

LRRC45, Leucine-rich repeat-containing protein 45, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC45Q96CN5 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
LRRC45Q96CN5 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
LRRC45Q96CN5 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
LRRC45Q96CN5 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
LRRC45Q96CN5 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
LRRC45Q96CN5 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
LRRC45Q96CN5 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
LRRC45Q96CN5 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
LRRC45Q96CN5 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
LRRC45Q96CN5 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
LRRC45Q96CN5 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
LRRC45Q96CN5 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
LRRC45Q96CN5 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
LRRC45Q96CN5 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
LRRC45Q96CN5 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
LRRC45Q96CN5 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
LRRC45Q96CN5 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
LRRC45Q96CN5 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
LRRC45Q96CN5 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
LRRC45Q96CN5 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
LRRC45Q96CN5 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
LRRC45Q96CN5 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
LRRC45Q96CN5 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
LRRC45Q96CN5 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
LRRC45Q96CN5 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
LRRC45Q96CN5 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
LRRC45Q96CN5 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
LRRC45Q96CN5 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
LRRC45Q96CN5 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
LRRC45Q96CN5 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
LRRC45Q96CN5 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
LRRC45Q96CN5 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
LRRC45Q96CN5 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
LRRC45Q96CN5 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
LRRC45Q96CN5 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
LRRC45Q96CN5 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
LRRC45Q96CN5 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
LRRC45Q96CN5 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
LRRC45Q96CN5 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
LRRC45Q96CN5 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
LRRC45Q96CN5 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
LRRC45Q96CN5 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
LRRC45Q96CN5 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
LRRC45Q96CN5 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
LRRC45Q96CN5 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
LRRC45Q96CN5 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
LRRC45Q96CN5 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
LRRC45Q96CN5 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
LRRC45Q96CN5 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
LRRC45Q96CN5 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
LRRC45Q96CN5 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
LRRC45Q96CN5 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
LRRC45Q96CN5 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
LRRC45Q96CN5 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
LRRC45Q96CN5 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
LRRC45Q96CN5 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
LRRC45Q96CN5 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
LRRC45Q96CN5 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
LRRC45Q96CN5 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LRRC45Q96CN5 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LRRC45Q96CN5 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
LRRC45Q96CN5 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
LRRC45Q96CN5 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
LRRC45Q96CN5 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
LRRC45Q96CN5 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
LRRC45Q96CN5 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LRRC45Q96CN5 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LRRC45Q96CN5 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LRRC45Q96CN5 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LRRC45Q96CN5 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
LRRC45Q96CN5 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
LRRC45Q96CN5 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
LRRC45Q96CN5 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
LRRC45Q96CN5 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
LRRC45Q96CN5 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
LRRC45Q96CN5 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
LRRC45Q96CN5 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
LRRC45Q96CN5 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
LRRC45Q96CN5 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
LRRC45Q96CN5 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
LRRC45Q96CN5 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
LRRC45Q96CN5 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
LRRC45Q96CN5 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
LRRC45Q96CN5 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
LRRC45Q96CN5 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
LRRC45Q96CN5 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
LRRC45Q96CN5 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
LRRC45Q96CN5 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
LRRC45Q96CN5 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
LRRC45Q96CN5 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
LRRC45Q96CN5 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
LRRC45Q96CN5 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
LRRC45Q96CN5 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
LRRC45Q96CN5 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
LRRC45Q96CN5 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
LRRC45Q96CN5 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
LRRC45Q96CN5 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
LRRC45Q96CN5 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
LRRC45Q96CN5 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
LRRC45Q96CN5 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.7 ms