Protein–RNA interactions for Protein: Q96BT3

CENPT, Centromere protein T, humanhuman

Predictions only

Length 561 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPTQ96BT3 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CENPTQ96BT3 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.08
CENPTQ96BT3 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
CENPTQ96BT3 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
CENPTQ96BT3 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CENPTQ96BT3 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CENPTQ96BT3 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CENPTQ96BT3 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CENPTQ96BT3 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CENPTQ96BT3 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CENPTQ96BT3 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CENPTQ96BT3 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CENPTQ96BT3 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CENPTQ96BT3 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CENPTQ96BT3 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CENPTQ96BT3 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CENPTQ96BT3 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CENPTQ96BT3 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CENPTQ96BT3 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CENPTQ96BT3 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CENPTQ96BT3 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CENPTQ96BT3 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CENPTQ96BT3 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CENPTQ96BT3 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CENPTQ96BT3 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CENPTQ96BT3 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CENPTQ96BT3 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
CENPTQ96BT3 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CENPTQ96BT3 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CENPTQ96BT3 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CENPTQ96BT3 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CENPTQ96BT3 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CENPTQ96BT3 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CENPTQ96BT3 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CENPTQ96BT3 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
CENPTQ96BT3 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CENPTQ96BT3 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CENPTQ96BT3 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CENPTQ96BT3 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CENPTQ96BT3 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CENPTQ96BT3 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
CENPTQ96BT3 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CENPTQ96BT3 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CENPTQ96BT3 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CENPTQ96BT3 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CENPTQ96BT3 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CENPTQ96BT3 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CENPTQ96BT3 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CENPTQ96BT3 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CENPTQ96BT3 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CENPTQ96BT3 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CENPTQ96BT3 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CENPTQ96BT3 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CENPTQ96BT3 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CENPTQ96BT3 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CENPTQ96BT3 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CENPTQ96BT3 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CENPTQ96BT3 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CENPTQ96BT3 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CENPTQ96BT3 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CENPTQ96BT3 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CENPTQ96BT3 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CENPTQ96BT3 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CENPTQ96BT3 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CENPTQ96BT3 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CENPTQ96BT3 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CENPTQ96BT3 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CENPTQ96BT3 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CENPTQ96BT3 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CENPTQ96BT3 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CENPTQ96BT3 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CENPTQ96BT3 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CENPTQ96BT3 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CENPTQ96BT3 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CENPTQ96BT3 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CENPTQ96BT3 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CENPTQ96BT3 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
CENPTQ96BT3 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CENPTQ96BT3 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CENPTQ96BT3 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
CENPTQ96BT3 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CENPTQ96BT3 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CENPTQ96BT3 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
CENPTQ96BT3 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CENPTQ96BT3 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CENPTQ96BT3 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CENPTQ96BT3 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CENPTQ96BT3 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CENPTQ96BT3 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CENPTQ96BT3 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CENPTQ96BT3 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CENPTQ96BT3 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CENPTQ96BT3 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CENPTQ96BT3 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CENPTQ96BT3 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
CENPTQ96BT3 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CENPTQ96BT3 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CENPTQ96BT3 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
CENPTQ96BT3 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CENPTQ96BT3 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 127.1 ms