Protein–RNA interactions for Protein: Q96A56

TP53INP1, Tumor protein p53-inducible nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP53INP1Q96A56 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TP53INP1Q96A56 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TP53INP1Q96A56 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TP53INP1Q96A56 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TP53INP1Q96A56 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TP53INP1Q96A56 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TP53INP1Q96A56 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TP53INP1Q96A56 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TP53INP1Q96A56 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TP53INP1Q96A56 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TP53INP1Q96A56 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TP53INP1Q96A56 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TP53INP1Q96A56 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TP53INP1Q96A56 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TP53INP1Q96A56 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TP53INP1Q96A56 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TP53INP1Q96A56 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TP53INP1Q96A56 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TP53INP1Q96A56 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TP53INP1Q96A56 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TP53INP1Q96A56 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TP53INP1Q96A56 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
TP53INP1Q96A56 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TP53INP1Q96A56 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TP53INP1Q96A56 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TP53INP1Q96A56 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TP53INP1Q96A56 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TP53INP1Q96A56 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TP53INP1Q96A56 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TP53INP1Q96A56 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TP53INP1Q96A56 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TP53INP1Q96A56 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
TP53INP1Q96A56 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TP53INP1Q96A56 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
TP53INP1Q96A56 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
TP53INP1Q96A56 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TP53INP1Q96A56 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TP53INP1Q96A56 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TP53INP1Q96A56 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TP53INP1Q96A56 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TP53INP1Q96A56 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TP53INP1Q96A56 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TP53INP1Q96A56 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TP53INP1Q96A56 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TP53INP1Q96A56 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TP53INP1Q96A56 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TP53INP1Q96A56 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
TP53INP1Q96A56 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TP53INP1Q96A56 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TP53INP1Q96A56 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TP53INP1Q96A56 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TP53INP1Q96A56 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
TP53INP1Q96A56 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TP53INP1Q96A56 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TP53INP1Q96A56 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TP53INP1Q96A56 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.6
TP53INP1Q96A56 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TP53INP1Q96A56 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TP53INP1Q96A56 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TP53INP1Q96A56 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TP53INP1Q96A56 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TP53INP1Q96A56 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TP53INP1Q96A56 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TP53INP1Q96A56 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TP53INP1Q96A56 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TP53INP1Q96A56 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TP53INP1Q96A56 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TP53INP1Q96A56 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TP53INP1Q96A56 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TP53INP1Q96A56 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TP53INP1Q96A56 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TP53INP1Q96A56 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TP53INP1Q96A56 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TP53INP1Q96A56 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TP53INP1Q96A56 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TP53INP1Q96A56 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TP53INP1Q96A56 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TP53INP1Q96A56 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TP53INP1Q96A56 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TP53INP1Q96A56 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TP53INP1Q96A56 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TP53INP1Q96A56 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TP53INP1Q96A56 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TP53INP1Q96A56 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TP53INP1Q96A56 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TP53INP1Q96A56 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TP53INP1Q96A56 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TP53INP1Q96A56 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TP53INP1Q96A56 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TP53INP1Q96A56 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TP53INP1Q96A56 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TP53INP1Q96A56 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TP53INP1Q96A56 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TP53INP1Q96A56 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TP53INP1Q96A56 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TP53INP1Q96A56 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TP53INP1Q96A56 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TP53INP1Q96A56 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TP53INP1Q96A56 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TP53INP1Q96A56 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms