Protein–RNA interactions for Protein: Q96A33

CCDC47, Coiled-coil domain-containing protein 47, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC47Q96A33 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC30.33■■■□□ 2.45
CCDC47Q96A33 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
CCDC47Q96A33 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
CCDC47Q96A33 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
CCDC47Q96A33 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
CCDC47Q96A33 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
CCDC47Q96A33 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
CCDC47Q96A33 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
CCDC47Q96A33 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC30.27■■■□□ 2.44
CCDC47Q96A33 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
CCDC47Q96A33 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
CCDC47Q96A33 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
CCDC47Q96A33 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
CCDC47Q96A33 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
CCDC47Q96A33 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
CCDC47Q96A33 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
CCDC47Q96A33 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
CCDC47Q96A33 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
CCDC47Q96A33 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.43
CCDC47Q96A33 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
CCDC47Q96A33 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
CCDC47Q96A33 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CCDC47Q96A33 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC30.14■■■□□ 2.42
CCDC47Q96A33 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
CCDC47Q96A33 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
CCDC47Q96A33 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
CCDC47Q96A33 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC30.13■■■□□ 2.41
CCDC47Q96A33 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
CCDC47Q96A33 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
CCDC47Q96A33 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
CCDC47Q96A33 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
CCDC47Q96A33 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CCDC47Q96A33 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
CCDC47Q96A33 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CCDC47Q96A33 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
CCDC47Q96A33 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CCDC47Q96A33 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CCDC47Q96A33 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CCDC47Q96A33 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC30.09■■■□□ 2.41
CCDC47Q96A33 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
CCDC47Q96A33 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CCDC47Q96A33 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CCDC47Q96A33 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
CCDC47Q96A33 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
CCDC47Q96A33 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
CCDC47Q96A33 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
CCDC47Q96A33 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CCDC47Q96A33 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CCDC47Q96A33 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
CCDC47Q96A33 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CCDC47Q96A33 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
CCDC47Q96A33 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
CCDC47Q96A33 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
CCDC47Q96A33 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CCDC47Q96A33 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CCDC47Q96A33 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CCDC47Q96A33 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CCDC47Q96A33 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CCDC47Q96A33 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CCDC47Q96A33 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CCDC47Q96A33 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CCDC47Q96A33 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
CCDC47Q96A33 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CCDC47Q96A33 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
CCDC47Q96A33 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
CCDC47Q96A33 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CCDC47Q96A33 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
CCDC47Q96A33 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CCDC47Q96A33 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CCDC47Q96A33 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CCDC47Q96A33 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
CCDC47Q96A33 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CCDC47Q96A33 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CCDC47Q96A33 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CCDC47Q96A33 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CCDC47Q96A33 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
CCDC47Q96A33 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CCDC47Q96A33 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CCDC47Q96A33 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CCDC47Q96A33 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CCDC47Q96A33 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CCDC47Q96A33 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CCDC47Q96A33 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CCDC47Q96A33 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CCDC47Q96A33 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CCDC47Q96A33 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CCDC47Q96A33 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CCDC47Q96A33 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CCDC47Q96A33 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CCDC47Q96A33 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CCDC47Q96A33 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CCDC47Q96A33 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CCDC47Q96A33 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CCDC47Q96A33 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
CCDC47Q96A33 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CCDC47Q96A33 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CCDC47Q96A33 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
CCDC47Q96A33 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
CCDC47Q96A33 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CCDC47Q96A33 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
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