Protein–RNA interactions for Protein: Q969X5

ERGIC1, Endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERGIC1Q969X5 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ERGIC1Q969X5 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ERGIC1Q969X5 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ERGIC1Q969X5 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ERGIC1Q969X5 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ERGIC1Q969X5 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ERGIC1Q969X5 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ERGIC1Q969X5 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ERGIC1Q969X5 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ERGIC1Q969X5 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ERGIC1Q969X5 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ERGIC1Q969X5 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ERGIC1Q969X5 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ERGIC1Q969X5 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ERGIC1Q969X5 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ERGIC1Q969X5 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ERGIC1Q969X5 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ERGIC1Q969X5 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ERGIC1Q969X5 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ERGIC1Q969X5 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ERGIC1Q969X5 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
ERGIC1Q969X5 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ERGIC1Q969X5 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ERGIC1Q969X5 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ERGIC1Q969X5 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ERGIC1Q969X5 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ERGIC1Q969X5 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ERGIC1Q969X5 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ERGIC1Q969X5 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ERGIC1Q969X5 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ERGIC1Q969X5 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ERGIC1Q969X5 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ERGIC1Q969X5 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ERGIC1Q969X5 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ERGIC1Q969X5 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ERGIC1Q969X5 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ERGIC1Q969X5 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ERGIC1Q969X5 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ERGIC1Q969X5 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ERGIC1Q969X5 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ERGIC1Q969X5 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ERGIC1Q969X5 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ERGIC1Q969X5 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ERGIC1Q969X5 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ERGIC1Q969X5 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ERGIC1Q969X5 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
ERGIC1Q969X5 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ERGIC1Q969X5 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ERGIC1Q969X5 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ERGIC1Q969X5 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ERGIC1Q969X5 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ERGIC1Q969X5 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ERGIC1Q969X5 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ERGIC1Q969X5 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ERGIC1Q969X5 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ERGIC1Q969X5 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ERGIC1Q969X5 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ERGIC1Q969X5 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
ERGIC1Q969X5 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ERGIC1Q969X5 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ERGIC1Q969X5 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ERGIC1Q969X5 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ERGIC1Q969X5 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ERGIC1Q969X5 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
ERGIC1Q969X5 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ERGIC1Q969X5 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ERGIC1Q969X5 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ERGIC1Q969X5 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ERGIC1Q969X5 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ERGIC1Q969X5 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ERGIC1Q969X5 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ERGIC1Q969X5 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ERGIC1Q969X5 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ERGIC1Q969X5 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ERGIC1Q969X5 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ERGIC1Q969X5 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ERGIC1Q969X5 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ERGIC1Q969X5 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ERGIC1Q969X5 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ERGIC1Q969X5 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ERGIC1Q969X5 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ERGIC1Q969X5 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ERGIC1Q969X5 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ERGIC1Q969X5 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ERGIC1Q969X5 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ERGIC1Q969X5 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ERGIC1Q969X5 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ERGIC1Q969X5 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ERGIC1Q969X5 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ERGIC1Q969X5 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ERGIC1Q969X5 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ERGIC1Q969X5 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ERGIC1Q969X5 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ERGIC1Q969X5 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ERGIC1Q969X5 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ERGIC1Q969X5 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ERGIC1Q969X5 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ERGIC1Q969X5 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ERGIC1Q969X5 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ERGIC1Q969X5 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms