Protein–RNA interactions for Protein: Q969S0

SLC35B4, UDP-xylose and UDP-N-acetylglucosamine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC35B4Q969S0 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC35B4Q969S0 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC35B4Q969S0 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC35B4Q969S0 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC35B4Q969S0 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC35B4Q969S0 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC35B4Q969S0 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC35B4Q969S0 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC35B4Q969S0 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC35B4Q969S0 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC35B4Q969S0 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC35B4Q969S0 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC35B4Q969S0 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
SLC35B4Q969S0 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC35B4Q969S0 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC35B4Q969S0 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC35B4Q969S0 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC35B4Q969S0 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC35B4Q969S0 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC35B4Q969S0 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC35B4Q969S0 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC35B4Q969S0 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC35B4Q969S0 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC35B4Q969S0 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC35B4Q969S0 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC35B4Q969S0 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC35B4Q969S0 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC35B4Q969S0 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC35B4Q969S0 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC35B4Q969S0 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC35B4Q969S0 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC35B4Q969S0 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC35B4Q969S0 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC35B4Q969S0 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC35B4Q969S0 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC35B4Q969S0 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC35B4Q969S0 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC35B4Q969S0 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC35B4Q969S0 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC35B4Q969S0 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC35B4Q969S0 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC35B4Q969S0 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC35B4Q969S0 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC35B4Q969S0 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC35B4Q969S0 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC35B4Q969S0 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC35B4Q969S0 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC35B4Q969S0 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC35B4Q969S0 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC35B4Q969S0 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC35B4Q969S0 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC35B4Q969S0 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC35B4Q969S0 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC35B4Q969S0 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC35B4Q969S0 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC35B4Q969S0 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC35B4Q969S0 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC35B4Q969S0 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC35B4Q969S0 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC35B4Q969S0 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC35B4Q969S0 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC35B4Q969S0 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC35B4Q969S0 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC35B4Q969S0 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC35B4Q969S0 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC35B4Q969S0 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC35B4Q969S0 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC35B4Q969S0 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC35B4Q969S0 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC35B4Q969S0 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC35B4Q969S0 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC35B4Q969S0 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC35B4Q969S0 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC35B4Q969S0 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC35B4Q969S0 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC35B4Q969S0 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC35B4Q969S0 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC35B4Q969S0 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC35B4Q969S0 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC35B4Q969S0 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC35B4Q969S0 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC35B4Q969S0 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC35B4Q969S0 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC35B4Q969S0 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC35B4Q969S0 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC35B4Q969S0 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC35B4Q969S0 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC35B4Q969S0 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC35B4Q969S0 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC35B4Q969S0 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC35B4Q969S0 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC35B4Q969S0 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC35B4Q969S0 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC35B4Q969S0 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC35B4Q969S0 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC35B4Q969S0 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC35B4Q969S0 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC35B4Q969S0 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC35B4Q969S0 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC35B4Q969S0 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms