Protein–RNA interactions for Protein: Q93063

EXT2, Exostosin-2, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXT2Q93063 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
EXT2Q93063 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
EXT2Q93063 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
EXT2Q93063 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
EXT2Q93063 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
EXT2Q93063 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
EXT2Q93063 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
EXT2Q93063 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
EXT2Q93063 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
EXT2Q93063 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
EXT2Q93063 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
EXT2Q93063 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
EXT2Q93063 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
EXT2Q93063 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
EXT2Q93063 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
EXT2Q93063 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
EXT2Q93063 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
EXT2Q93063 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
EXT2Q93063 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
EXT2Q93063 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
EXT2Q93063 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
EXT2Q93063 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
EXT2Q93063 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
EXT2Q93063 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
EXT2Q93063 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
EXT2Q93063 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
EXT2Q93063 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
EXT2Q93063 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
EXT2Q93063 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
EXT2Q93063 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
EXT2Q93063 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
EXT2Q93063 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
EXT2Q93063 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
EXT2Q93063 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
EXT2Q93063 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
EXT2Q93063 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
EXT2Q93063 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
EXT2Q93063 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
EXT2Q93063 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
EXT2Q93063 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
EXT2Q93063 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
EXT2Q93063 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
EXT2Q93063 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
EXT2Q93063 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
EXT2Q93063 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
EXT2Q93063 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
EXT2Q93063 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
EXT2Q93063 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
EXT2Q93063 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
EXT2Q93063 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
EXT2Q93063 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
EXT2Q93063 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
EXT2Q93063 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
EXT2Q93063 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
EXT2Q93063 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
EXT2Q93063 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
EXT2Q93063 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
EXT2Q93063 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
EXT2Q93063 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
EXT2Q93063 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
EXT2Q93063 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
EXT2Q93063 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
EXT2Q93063 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
EXT2Q93063 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
EXT2Q93063 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
EXT2Q93063 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
EXT2Q93063 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
EXT2Q93063 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
EXT2Q93063 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
EXT2Q93063 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
EXT2Q93063 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
EXT2Q93063 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
EXT2Q93063 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
EXT2Q93063 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
EXT2Q93063 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
EXT2Q93063 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
EXT2Q93063 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
EXT2Q93063 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
EXT2Q93063 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
EXT2Q93063 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
EXT2Q93063 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
EXT2Q93063 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
EXT2Q93063 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
EXT2Q93063 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
EXT2Q93063 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
EXT2Q93063 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
EXT2Q93063 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
EXT2Q93063 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
EXT2Q93063 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
EXT2Q93063 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
EXT2Q93063 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
EXT2Q93063 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
EXT2Q93063 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
EXT2Q93063 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
EXT2Q93063 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
EXT2Q93063 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
EXT2Q93063 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
EXT2Q93063 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
EXT2Q93063 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
EXT2Q93063 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms