Protein–RNA interactions for Protein: Q92791

P3H4, Endoplasmic reticulum protein SC65, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P3H4Q92791 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
P3H4Q92791 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
P3H4Q92791 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
P3H4Q92791 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
P3H4Q92791 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
P3H4Q92791 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
P3H4Q92791 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
P3H4Q92791 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
P3H4Q92791 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
P3H4Q92791 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
P3H4Q92791 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
P3H4Q92791 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
P3H4Q92791 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
P3H4Q92791 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
P3H4Q92791 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
P3H4Q92791 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
P3H4Q92791 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
P3H4Q92791 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
P3H4Q92791 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
P3H4Q92791 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
P3H4Q92791 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
P3H4Q92791 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
P3H4Q92791 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
P3H4Q92791 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
P3H4Q92791 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
P3H4Q92791 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
P3H4Q92791 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
P3H4Q92791 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
P3H4Q92791 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
P3H4Q92791 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
P3H4Q92791 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
P3H4Q92791 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
P3H4Q92791 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
P3H4Q92791 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
P3H4Q92791 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
P3H4Q92791 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
P3H4Q92791 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
P3H4Q92791 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
P3H4Q92791 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
P3H4Q92791 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
P3H4Q92791 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
P3H4Q92791 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
P3H4Q92791 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
P3H4Q92791 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
P3H4Q92791 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
P3H4Q92791 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
P3H4Q92791 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
P3H4Q92791 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
P3H4Q92791 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
P3H4Q92791 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
P3H4Q92791 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
P3H4Q92791 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
P3H4Q92791 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
P3H4Q92791 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
P3H4Q92791 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
P3H4Q92791 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
P3H4Q92791 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
P3H4Q92791 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
P3H4Q92791 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
P3H4Q92791 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
P3H4Q92791 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
P3H4Q92791 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
P3H4Q92791 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
P3H4Q92791 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
P3H4Q92791 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
P3H4Q92791 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
P3H4Q92791 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
P3H4Q92791 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
P3H4Q92791 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
P3H4Q92791 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
P3H4Q92791 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
P3H4Q92791 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
P3H4Q92791 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
P3H4Q92791 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
P3H4Q92791 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
P3H4Q92791 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
P3H4Q92791 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
P3H4Q92791 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
P3H4Q92791 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
P3H4Q92791 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
P3H4Q92791 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
P3H4Q92791 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
P3H4Q92791 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
P3H4Q92791 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
P3H4Q92791 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
P3H4Q92791 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
P3H4Q92791 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
P3H4Q92791 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
P3H4Q92791 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
P3H4Q92791 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
P3H4Q92791 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
P3H4Q92791 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
P3H4Q92791 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
P3H4Q92791 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
P3H4Q92791 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
P3H4Q92791 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
P3H4Q92791 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
P3H4Q92791 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
P3H4Q92791 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
P3H4Q92791 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63 ms