Protein–RNA interactions for Protein: Q92622

RUBCN, Run domain Beclin-1-interacting and cysteine-rich domain-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 972 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUBCNQ92622 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
RUBCNQ92622 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
RUBCNQ92622 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
RUBCNQ92622 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
RUBCNQ92622 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
RUBCNQ92622 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
RUBCNQ92622 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
RUBCNQ92622 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
RUBCNQ92622 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
RUBCNQ92622 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
RUBCNQ92622 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
RUBCNQ92622 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
RUBCNQ92622 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RUBCNQ92622 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RUBCNQ92622 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
RUBCNQ92622 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
RUBCNQ92622 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC29■■■□□ 2.23
RUBCNQ92622 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
RUBCNQ92622 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
RUBCNQ92622 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
RUBCNQ92622 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
RUBCNQ92622 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
RUBCNQ92622 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
RUBCNQ92622 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
RUBCNQ92622 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
RUBCNQ92622 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
RUBCNQ92622 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
RUBCNQ92622 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RUBCNQ92622 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
RUBCNQ92622 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RUBCNQ92622 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
RUBCNQ92622 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
RUBCNQ92622 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
RUBCNQ92622 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RUBCNQ92622 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
RUBCNQ92622 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
RUBCNQ92622 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
RUBCNQ92622 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
RUBCNQ92622 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
RUBCNQ92622 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
RUBCNQ92622 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
RUBCNQ92622 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
RUBCNQ92622 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RUBCNQ92622 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RUBCNQ92622 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
RUBCNQ92622 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RUBCNQ92622 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
RUBCNQ92622 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
RUBCNQ92622 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RUBCNQ92622 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
RUBCNQ92622 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RUBCNQ92622 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RUBCNQ92622 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
RUBCNQ92622 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
RUBCNQ92622 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RUBCNQ92622 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RUBCNQ92622 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
RUBCNQ92622 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
RUBCNQ92622 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
RUBCNQ92622 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RUBCNQ92622 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
RUBCNQ92622 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RUBCNQ92622 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RUBCNQ92622 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
RUBCNQ92622 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
RUBCNQ92622 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
RUBCNQ92622 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RUBCNQ92622 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RUBCNQ92622 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
RUBCNQ92622 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
RUBCNQ92622 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
RUBCNQ92622 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
RUBCNQ92622 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
RUBCNQ92622 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
RUBCNQ92622 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
RUBCNQ92622 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
RUBCNQ92622 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
RUBCNQ92622 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
RUBCNQ92622 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
RUBCNQ92622 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
RUBCNQ92622 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RUBCNQ92622 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RUBCNQ92622 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
RUBCNQ92622 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
RUBCNQ92622 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
RUBCNQ92622 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
RUBCNQ92622 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
RUBCNQ92622 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
RUBCNQ92622 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
RUBCNQ92622 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
RUBCNQ92622 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
RUBCNQ92622 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
RUBCNQ92622 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
RUBCNQ92622 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
RUBCNQ92622 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
RUBCNQ92622 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
RUBCNQ92622 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
RUBCNQ92622 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
RUBCNQ92622 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
RUBCNQ92622 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms