Protein–RNA interactions for Protein: Q92466

DDB2, DNA damage-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB2Q92466 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DDB2Q92466 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DDB2Q92466 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DDB2Q92466 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DDB2Q92466 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DDB2Q92466 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DDB2Q92466 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DDB2Q92466 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DDB2Q92466 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DDB2Q92466 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DDB2Q92466 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DDB2Q92466 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
DDB2Q92466 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DDB2Q92466 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DDB2Q92466 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
DDB2Q92466 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DDB2Q92466 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DDB2Q92466 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DDB2Q92466 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DDB2Q92466 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DDB2Q92466 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DDB2Q92466 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DDB2Q92466 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DDB2Q92466 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DDB2Q92466 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DDB2Q92466 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DDB2Q92466 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DDB2Q92466 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DDB2Q92466 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DDB2Q92466 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DDB2Q92466 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
DDB2Q92466 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
DDB2Q92466 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
DDB2Q92466 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DDB2Q92466 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
DDB2Q92466 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
DDB2Q92466 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DDB2Q92466 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DDB2Q92466 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DDB2Q92466 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DDB2Q92466 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
DDB2Q92466 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DDB2Q92466 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DDB2Q92466 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DDB2Q92466 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DDB2Q92466 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DDB2Q92466 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DDB2Q92466 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DDB2Q92466 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DDB2Q92466 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DDB2Q92466 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DDB2Q92466 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DDB2Q92466 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
DDB2Q92466 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
DDB2Q92466 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
DDB2Q92466 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DDB2Q92466 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DDB2Q92466 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DDB2Q92466 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DDB2Q92466 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
DDB2Q92466 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
DDB2Q92466 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
DDB2Q92466 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DDB2Q92466 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DDB2Q92466 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
DDB2Q92466 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
DDB2Q92466 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DDB2Q92466 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DDB2Q92466 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DDB2Q92466 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
DDB2Q92466 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DDB2Q92466 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DDB2Q92466 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
DDB2Q92466 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DDB2Q92466 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DDB2Q92466 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
DDB2Q92466 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DDB2Q92466 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DDB2Q92466 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DDB2Q92466 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DDB2Q92466 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DDB2Q92466 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
DDB2Q92466 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DDB2Q92466 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DDB2Q92466 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DDB2Q92466 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
DDB2Q92466 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
DDB2Q92466 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DDB2Q92466 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DDB2Q92466 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DDB2Q92466 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DDB2Q92466 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DDB2Q92466 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DDB2Q92466 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DDB2Q92466 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DDB2Q92466 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DDB2Q92466 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
DDB2Q92466 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
DDB2Q92466 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
DDB2Q92466 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms