Protein–RNA interactions for Protein: Q91XV3

Basp1, Brain acid soluble protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Basp1Q91XV3 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Basp1Q91XV3 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Basp1Q91XV3 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Basp1Q91XV3 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Basp1Q91XV3 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Basp1Q91XV3 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Basp1Q91XV3 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Basp1Q91XV3 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Basp1Q91XV3 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Basp1Q91XV3 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Basp1Q91XV3 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Basp1Q91XV3 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Basp1Q91XV3 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Basp1Q91XV3 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Basp1Q91XV3 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Basp1Q91XV3 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Basp1Q91XV3 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Basp1Q91XV3 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Basp1Q91XV3 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Basp1Q91XV3 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Basp1Q91XV3 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Basp1Q91XV3 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Basp1Q91XV3 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Basp1Q91XV3 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Basp1Q91XV3 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Basp1Q91XV3 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Basp1Q91XV3 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Basp1Q91XV3 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Basp1Q91XV3 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Basp1Q91XV3 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Basp1Q91XV3 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Basp1Q91XV3 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Basp1Q91XV3 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Basp1Q91XV3 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Basp1Q91XV3 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Basp1Q91XV3 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Basp1Q91XV3 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Basp1Q91XV3 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Basp1Q91XV3 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Basp1Q91XV3 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Basp1Q91XV3 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Basp1Q91XV3 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Basp1Q91XV3 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Basp1Q91XV3 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Basp1Q91XV3 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Basp1Q91XV3 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Basp1Q91XV3 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Basp1Q91XV3 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Basp1Q91XV3 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Basp1Q91XV3 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Basp1Q91XV3 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Basp1Q91XV3 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Basp1Q91XV3 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Basp1Q91XV3 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Basp1Q91XV3 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Basp1Q91XV3 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Basp1Q91XV3 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Basp1Q91XV3 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Basp1Q91XV3 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Basp1Q91XV3 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Basp1Q91XV3 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Basp1Q91XV3 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Basp1Q91XV3 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Basp1Q91XV3 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Basp1Q91XV3 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Basp1Q91XV3 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Basp1Q91XV3 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Basp1Q91XV3 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Basp1Q91XV3 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Basp1Q91XV3 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
Basp1Q91XV3 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Basp1Q91XV3 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Basp1Q91XV3 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Basp1Q91XV3 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Basp1Q91XV3 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Basp1Q91XV3 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Basp1Q91XV3 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Basp1Q91XV3 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Basp1Q91XV3 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Basp1Q91XV3 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Basp1Q91XV3 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Basp1Q91XV3 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Basp1Q91XV3 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Basp1Q91XV3 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Basp1Q91XV3 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Basp1Q91XV3 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Basp1Q91XV3 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Basp1Q91XV3 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Basp1Q91XV3 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Basp1Q91XV3 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Basp1Q91XV3 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Basp1Q91XV3 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Basp1Q91XV3 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Basp1Q91XV3 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Basp1Q91XV3 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Basp1Q91XV3 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Basp1Q91XV3 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Basp1Q91XV3 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Basp1Q91XV3 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Basp1Q91XV3 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms