Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXC6

COPS9, COP9 signalosome complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS9Q8WXC6 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
COPS9Q8WXC6 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
COPS9Q8WXC6 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
COPS9Q8WXC6 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
COPS9Q8WXC6 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
COPS9Q8WXC6 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
COPS9Q8WXC6 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
COPS9Q8WXC6 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
COPS9Q8WXC6 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
COPS9Q8WXC6 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
COPS9Q8WXC6 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
COPS9Q8WXC6 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
COPS9Q8WXC6 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
COPS9Q8WXC6 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
COPS9Q8WXC6 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
COPS9Q8WXC6 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
COPS9Q8WXC6 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
COPS9Q8WXC6 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COPS9Q8WXC6 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
COPS9Q8WXC6 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
COPS9Q8WXC6 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
COPS9Q8WXC6 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
COPS9Q8WXC6 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
COPS9Q8WXC6 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
COPS9Q8WXC6 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
COPS9Q8WXC6 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
COPS9Q8WXC6 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
COPS9Q8WXC6 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
COPS9Q8WXC6 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
COPS9Q8WXC6 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
COPS9Q8WXC6 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
COPS9Q8WXC6 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
COPS9Q8WXC6 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
COPS9Q8WXC6 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
COPS9Q8WXC6 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
COPS9Q8WXC6 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
COPS9Q8WXC6 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
COPS9Q8WXC6 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
COPS9Q8WXC6 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
COPS9Q8WXC6 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
COPS9Q8WXC6 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
COPS9Q8WXC6 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
COPS9Q8WXC6 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
COPS9Q8WXC6 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
COPS9Q8WXC6 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
COPS9Q8WXC6 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
COPS9Q8WXC6 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
COPS9Q8WXC6 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
COPS9Q8WXC6 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
COPS9Q8WXC6 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COPS9Q8WXC6 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COPS9Q8WXC6 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
COPS9Q8WXC6 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
COPS9Q8WXC6 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
COPS9Q8WXC6 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
COPS9Q8WXC6 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
COPS9Q8WXC6 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
COPS9Q8WXC6 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
COPS9Q8WXC6 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COPS9Q8WXC6 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COPS9Q8WXC6 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
COPS9Q8WXC6 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
COPS9Q8WXC6 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
COPS9Q8WXC6 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
COPS9Q8WXC6 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
COPS9Q8WXC6 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
COPS9Q8WXC6 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
COPS9Q8WXC6 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
COPS9Q8WXC6 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
COPS9Q8WXC6 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
COPS9Q8WXC6 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
COPS9Q8WXC6 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
COPS9Q8WXC6 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
COPS9Q8WXC6 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
COPS9Q8WXC6 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
COPS9Q8WXC6 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COPS9Q8WXC6 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
COPS9Q8WXC6 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COPS9Q8WXC6 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
COPS9Q8WXC6 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
COPS9Q8WXC6 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
COPS9Q8WXC6 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
COPS9Q8WXC6 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
COPS9Q8WXC6 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
COPS9Q8WXC6 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
COPS9Q8WXC6 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
COPS9Q8WXC6 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
COPS9Q8WXC6 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
COPS9Q8WXC6 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
COPS9Q8WXC6 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
COPS9Q8WXC6 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
COPS9Q8WXC6 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
COPS9Q8WXC6 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
COPS9Q8WXC6 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
COPS9Q8WXC6 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
COPS9Q8WXC6 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
COPS9Q8WXC6 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
COPS9Q8WXC6 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
COPS9Q8WXC6 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
COPS9Q8WXC6 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.2 ms