Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVP5

TNFAIP8L1, Tumor necrosis factor alpha-induced protein 8-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFAIP8L1Q8WVP5 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNFAIP8L1Q8WVP5 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNFAIP8L1Q8WVP5 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNFAIP8L1Q8WVP5 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNFAIP8L1Q8WVP5 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TNFAIP8L1Q8WVP5 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNFAIP8L1Q8WVP5 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNFAIP8L1Q8WVP5 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNFAIP8L1Q8WVP5 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TNFAIP8L1Q8WVP5 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TNFAIP8L1Q8WVP5 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TNFAIP8L1Q8WVP5 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNFAIP8L1Q8WVP5 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNFAIP8L1Q8WVP5 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNFAIP8L1Q8WVP5 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TNFAIP8L1Q8WVP5 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNFAIP8L1Q8WVP5 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNFAIP8L1Q8WVP5 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNFAIP8L1Q8WVP5 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNFAIP8L1Q8WVP5 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNFAIP8L1Q8WVP5 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNFAIP8L1Q8WVP5 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNFAIP8L1Q8WVP5 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TNFAIP8L1Q8WVP5 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNFAIP8L1Q8WVP5 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TNFAIP8L1Q8WVP5 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TNFAIP8L1Q8WVP5 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TNFAIP8L1Q8WVP5 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TNFAIP8L1Q8WVP5 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TNFAIP8L1Q8WVP5 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TNFAIP8L1Q8WVP5 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TNFAIP8L1Q8WVP5 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TNFAIP8L1Q8WVP5 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNFAIP8L1Q8WVP5 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNFAIP8L1Q8WVP5 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TNFAIP8L1Q8WVP5 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TNFAIP8L1Q8WVP5 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TNFAIP8L1Q8WVP5 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TNFAIP8L1Q8WVP5 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TNFAIP8L1Q8WVP5 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TNFAIP8L1Q8WVP5 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TNFAIP8L1Q8WVP5 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TNFAIP8L1Q8WVP5 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TNFAIP8L1Q8WVP5 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TNFAIP8L1Q8WVP5 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TNFAIP8L1Q8WVP5 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNFAIP8L1Q8WVP5 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TNFAIP8L1Q8WVP5 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNFAIP8L1Q8WVP5 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNFAIP8L1Q8WVP5 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNFAIP8L1Q8WVP5 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNFAIP8L1Q8WVP5 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TNFAIP8L1Q8WVP5 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNFAIP8L1Q8WVP5 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TNFAIP8L1Q8WVP5 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TNFAIP8L1Q8WVP5 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TNFAIP8L1Q8WVP5 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TNFAIP8L1Q8WVP5 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNFAIP8L1Q8WVP5 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNFAIP8L1Q8WVP5 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TNFAIP8L1Q8WVP5 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNFAIP8L1Q8WVP5 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNFAIP8L1Q8WVP5 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNFAIP8L1Q8WVP5 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNFAIP8L1Q8WVP5 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNFAIP8L1Q8WVP5 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNFAIP8L1Q8WVP5 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNFAIP8L1Q8WVP5 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNFAIP8L1Q8WVP5 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNFAIP8L1Q8WVP5 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNFAIP8L1Q8WVP5 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNFAIP8L1Q8WVP5 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNFAIP8L1Q8WVP5 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNFAIP8L1Q8WVP5 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNFAIP8L1Q8WVP5 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
TNFAIP8L1Q8WVP5 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNFAIP8L1Q8WVP5 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNFAIP8L1Q8WVP5 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNFAIP8L1Q8WVP5 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNFAIP8L1Q8WVP5 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNFAIP8L1Q8WVP5 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNFAIP8L1Q8WVP5 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNFAIP8L1Q8WVP5 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TNFAIP8L1Q8WVP5 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNFAIP8L1Q8WVP5 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNFAIP8L1Q8WVP5 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNFAIP8L1Q8WVP5 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNFAIP8L1Q8WVP5 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TNFAIP8L1Q8WVP5 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TNFAIP8L1Q8WVP5 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TNFAIP8L1Q8WVP5 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TNFAIP8L1Q8WVP5 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TNFAIP8L1Q8WVP5 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TNFAIP8L1Q8WVP5 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TNFAIP8L1Q8WVP5 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNFAIP8L1Q8WVP5 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNFAIP8L1Q8WVP5 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNFAIP8L1Q8WVP5 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNFAIP8L1Q8WVP5 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNFAIP8L1Q8WVP5 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms