Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD6

CHPT1, Cholinephosphotransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHPT1Q8WUD6 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHPT1Q8WUD6 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHPT1Q8WUD6 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHPT1Q8WUD6 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHPT1Q8WUD6 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHPT1Q8WUD6 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHPT1Q8WUD6 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHPT1Q8WUD6 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHPT1Q8WUD6 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHPT1Q8WUD6 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHPT1Q8WUD6 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHPT1Q8WUD6 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHPT1Q8WUD6 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHPT1Q8WUD6 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHPT1Q8WUD6 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHPT1Q8WUD6 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHPT1Q8WUD6 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHPT1Q8WUD6 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHPT1Q8WUD6 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHPT1Q8WUD6 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHPT1Q8WUD6 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHPT1Q8WUD6 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHPT1Q8WUD6 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHPT1Q8WUD6 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHPT1Q8WUD6 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHPT1Q8WUD6 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHPT1Q8WUD6 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHPT1Q8WUD6 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHPT1Q8WUD6 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHPT1Q8WUD6 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHPT1Q8WUD6 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHPT1Q8WUD6 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHPT1Q8WUD6 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHPT1Q8WUD6 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHPT1Q8WUD6 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHPT1Q8WUD6 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CHPT1Q8WUD6 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CHPT1Q8WUD6 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CHPT1Q8WUD6 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CHPT1Q8WUD6 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CHPT1Q8WUD6 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHPT1Q8WUD6 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHPT1Q8WUD6 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHPT1Q8WUD6 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHPT1Q8WUD6 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHPT1Q8WUD6 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHPT1Q8WUD6 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHPT1Q8WUD6 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHPT1Q8WUD6 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHPT1Q8WUD6 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CHPT1Q8WUD6 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHPT1Q8WUD6 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHPT1Q8WUD6 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHPT1Q8WUD6 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHPT1Q8WUD6 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHPT1Q8WUD6 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHPT1Q8WUD6 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHPT1Q8WUD6 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHPT1Q8WUD6 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHPT1Q8WUD6 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHPT1Q8WUD6 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHPT1Q8WUD6 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHPT1Q8WUD6 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHPT1Q8WUD6 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHPT1Q8WUD6 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHPT1Q8WUD6 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHPT1Q8WUD6 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHPT1Q8WUD6 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHPT1Q8WUD6 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHPT1Q8WUD6 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHPT1Q8WUD6 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CHPT1Q8WUD6 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHPT1Q8WUD6 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHPT1Q8WUD6 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHPT1Q8WUD6 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHPT1Q8WUD6 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHPT1Q8WUD6 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHPT1Q8WUD6 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHPT1Q8WUD6 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CHPT1Q8WUD6 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHPT1Q8WUD6 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHPT1Q8WUD6 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHPT1Q8WUD6 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CHPT1Q8WUD6 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHPT1Q8WUD6 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHPT1Q8WUD6 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHPT1Q8WUD6 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHPT1Q8WUD6 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CHPT1Q8WUD6 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHPT1Q8WUD6 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHPT1Q8WUD6 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHPT1Q8WUD6 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHPT1Q8WUD6 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHPT1Q8WUD6 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHPT1Q8WUD6 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHPT1Q8WUD6 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHPT1Q8WUD6 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHPT1Q8WUD6 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHPT1Q8WUD6 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHPT1Q8WUD6 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.8 ms