Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCG4

C8g, Complement component C8 gamma chain, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8gQ8VCG4 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C8gQ8VCG4 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C8gQ8VCG4 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C8gQ8VCG4 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C8gQ8VCG4 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C8gQ8VCG4 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C8gQ8VCG4 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C8gQ8VCG4 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
C8gQ8VCG4 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C8gQ8VCG4 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C8gQ8VCG4 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C8gQ8VCG4 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C8gQ8VCG4 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
C8gQ8VCG4 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C8gQ8VCG4 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C8gQ8VCG4 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C8gQ8VCG4 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C8gQ8VCG4 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C8gQ8VCG4 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C8gQ8VCG4 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C8gQ8VCG4 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C8gQ8VCG4 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C8gQ8VCG4 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C8gQ8VCG4 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C8gQ8VCG4 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
C8gQ8VCG4 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C8gQ8VCG4 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C8gQ8VCG4 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C8gQ8VCG4 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C8gQ8VCG4 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C8gQ8VCG4 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C8gQ8VCG4 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C8gQ8VCG4 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C8gQ8VCG4 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C8gQ8VCG4 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
C8gQ8VCG4 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C8gQ8VCG4 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C8gQ8VCG4 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C8gQ8VCG4 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C8gQ8VCG4 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
C8gQ8VCG4 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C8gQ8VCG4 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C8gQ8VCG4 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C8gQ8VCG4 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C8gQ8VCG4 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C8gQ8VCG4 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C8gQ8VCG4 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
C8gQ8VCG4 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
C8gQ8VCG4 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
C8gQ8VCG4 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
C8gQ8VCG4 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
C8gQ8VCG4 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
C8gQ8VCG4 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
C8gQ8VCG4 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
C8gQ8VCG4 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
C8gQ8VCG4 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
C8gQ8VCG4 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
C8gQ8VCG4 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
C8gQ8VCG4 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
C8gQ8VCG4 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
C8gQ8VCG4 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
C8gQ8VCG4 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
C8gQ8VCG4 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
C8gQ8VCG4 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
C8gQ8VCG4 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
C8gQ8VCG4 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
C8gQ8VCG4 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
C8gQ8VCG4 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
C8gQ8VCG4 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
C8gQ8VCG4 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
C8gQ8VCG4 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
C8gQ8VCG4 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
C8gQ8VCG4 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
C8gQ8VCG4 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
C8gQ8VCG4 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
C8gQ8VCG4 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
C8gQ8VCG4 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
C8gQ8VCG4 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
C8gQ8VCG4 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
C8gQ8VCG4 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
C8gQ8VCG4 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
C8gQ8VCG4 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
C8gQ8VCG4 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
C8gQ8VCG4 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
C8gQ8VCG4 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
C8gQ8VCG4 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
C8gQ8VCG4 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
C8gQ8VCG4 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
C8gQ8VCG4 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
C8gQ8VCG4 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
C8gQ8VCG4 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
C8gQ8VCG4 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
C8gQ8VCG4 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
C8gQ8VCG4 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
C8gQ8VCG4 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
C8gQ8VCG4 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
C8gQ8VCG4 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
C8gQ8VCG4 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
C8gQ8VCG4 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
C8gQ8VCG4 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms