Protein–RNA interactions for Protein: Q8VC19

Alas1, 5-aminolevulinate synthase, nonspecific, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alas1Q8VC19 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Alas1Q8VC19 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Alas1Q8VC19 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Alas1Q8VC19 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Alas1Q8VC19 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Alas1Q8VC19 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Alas1Q8VC19 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Alas1Q8VC19 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Alas1Q8VC19 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Alas1Q8VC19 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Alas1Q8VC19 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Alas1Q8VC19 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Alas1Q8VC19 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Alas1Q8VC19 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Alas1Q8VC19 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Alas1Q8VC19 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Alas1Q8VC19 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Alas1Q8VC19 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Alas1Q8VC19 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Alas1Q8VC19 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Alas1Q8VC19 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Alas1Q8VC19 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Alas1Q8VC19 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Alas1Q8VC19 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Alas1Q8VC19 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Alas1Q8VC19 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Alas1Q8VC19 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Alas1Q8VC19 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Alas1Q8VC19 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Alas1Q8VC19 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Alas1Q8VC19 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Alas1Q8VC19 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Alas1Q8VC19 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Alas1Q8VC19 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Alas1Q8VC19 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Alas1Q8VC19 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Alas1Q8VC19 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Alas1Q8VC19 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Alas1Q8VC19 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Alas1Q8VC19 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Alas1Q8VC19 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Alas1Q8VC19 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Alas1Q8VC19 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Alas1Q8VC19 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Alas1Q8VC19 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Alas1Q8VC19 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Alas1Q8VC19 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Alas1Q8VC19 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Alas1Q8VC19 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Alas1Q8VC19 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Alas1Q8VC19 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Alas1Q8VC19 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Alas1Q8VC19 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Alas1Q8VC19 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Alas1Q8VC19 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Alas1Q8VC19 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Alas1Q8VC19 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Alas1Q8VC19 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
Alas1Q8VC19 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Alas1Q8VC19 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Alas1Q8VC19 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Alas1Q8VC19 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Alas1Q8VC19 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Alas1Q8VC19 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Alas1Q8VC19 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Alas1Q8VC19 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Alas1Q8VC19 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Alas1Q8VC19 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Alas1Q8VC19 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Alas1Q8VC19 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Alas1Q8VC19 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Alas1Q8VC19 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Alas1Q8VC19 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Alas1Q8VC19 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Alas1Q8VC19 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Alas1Q8VC19 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Alas1Q8VC19 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Alas1Q8VC19 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Alas1Q8VC19 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Alas1Q8VC19 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
Alas1Q8VC19 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Alas1Q8VC19 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Alas1Q8VC19 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Alas1Q8VC19 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Alas1Q8VC19 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Alas1Q8VC19 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Alas1Q8VC19 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Alas1Q8VC19 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Alas1Q8VC19 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Alas1Q8VC19 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Alas1Q8VC19 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Alas1Q8VC19 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Alas1Q8VC19 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Alas1Q8VC19 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Alas1Q8VC19 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Alas1Q8VC19 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Alas1Q8VC19 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Alas1Q8VC19 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Alas1Q8VC19 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Alas1Q8VC19 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 235.1 ms