Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEU7

RAPGEF6, Rap guanine nucleotide exchange factor 6, humanhuman

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Length 1,601 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPGEF6Q8TEU7 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC43.54■■■■■ 4.56
RAPGEF6Q8TEU7 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC43.51■■■■■ 4.56
RAPGEF6Q8TEU7 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC43.51■■■■■ 4.56
RAPGEF6Q8TEU7 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC43.51■■■■■ 4.56
RAPGEF6Q8TEU7 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.51■■■■■ 4.56
RAPGEF6Q8TEU7 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC43.49■■■■■ 4.55
RAPGEF6Q8TEU7 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.48■■■■■ 4.55
RAPGEF6Q8TEU7 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC43.48■■■■■ 4.55
RAPGEF6Q8TEU7 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC43.47■■■■■ 4.55
RAPGEF6Q8TEU7 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC43.46■■■■■ 4.55
RAPGEF6Q8TEU7 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC43.46■■■■■ 4.55
RAPGEF6Q8TEU7 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC43.46■■■■■ 4.55
RAPGEF6Q8TEU7 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC43.46■■■■■ 4.55
RAPGEF6Q8TEU7 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.42■■■■■ 4.54
RAPGEF6Q8TEU7 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.42■■■■■ 4.54
RAPGEF6Q8TEU7 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC43.4■■■■■ 4.54
RAPGEF6Q8TEU7 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.4■■■■■ 4.54
RAPGEF6Q8TEU7 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.4■■■■■ 4.54
RAPGEF6Q8TEU7 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC43.38■■■■■ 4.53
RAPGEF6Q8TEU7 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.38■■■■■ 4.53
RAPGEF6Q8TEU7 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC43.37■■■■■ 4.53
RAPGEF6Q8TEU7 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC43.36■■■■■ 4.53
RAPGEF6Q8TEU7 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC43.35■■■■■ 4.53
RAPGEF6Q8TEU7 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC43.34■■■■■ 4.53
RAPGEF6Q8TEU7 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC43.34■■■■■ 4.53
RAPGEF6Q8TEU7 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC43.33■■■■■ 4.53
RAPGEF6Q8TEU7 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC43.33■■■■■ 4.53
RAPGEF6Q8TEU7 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC43.32■■■■■ 4.53
RAPGEF6Q8TEU7 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.31■■■■■ 4.52
RAPGEF6Q8TEU7 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.27■■■■■ 4.52
RAPGEF6Q8TEU7 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC43.27■■■■■ 4.52
RAPGEF6Q8TEU7 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.27■■■■■ 4.52
RAPGEF6Q8TEU7 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.26■■■■■ 4.52
RAPGEF6Q8TEU7 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC43.26■■■■■ 4.52
RAPGEF6Q8TEU7 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC43.26■■■■■ 4.52
RAPGEF6Q8TEU7 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC43.25■■■■■ 4.51
RAPGEF6Q8TEU7 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC43.24■■■■■ 4.51
RAPGEF6Q8TEU7 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.23■■■■■ 4.51
RAPGEF6Q8TEU7 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.21■■■■■ 4.51
RAPGEF6Q8TEU7 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.2■■■■■ 4.51
RAPGEF6Q8TEU7 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC43.19■■■■■ 4.51
RAPGEF6Q8TEU7 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC43.19■■■■■ 4.5
RAPGEF6Q8TEU7 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.19■■■■■ 4.5
RAPGEF6Q8TEU7 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC43.19■■■■■ 4.5
RAPGEF6Q8TEU7 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.18■■■■■ 4.5
RAPGEF6Q8TEU7 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.17■■■■■ 4.5
RAPGEF6Q8TEU7 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.16■■■■■ 4.5
RAPGEF6Q8TEU7 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC43.15■■■■■ 4.5
RAPGEF6Q8TEU7 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC43.14■■■■■ 4.5
RAPGEF6Q8TEU7 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC43.13■■■■■ 4.49
RAPGEF6Q8TEU7 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.1■■■■■ 4.49
RAPGEF6Q8TEU7 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC43.06■■■■■ 4.48
RAPGEF6Q8TEU7 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC43.06■■■■■ 4.48
RAPGEF6Q8TEU7 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC43.06■■■■■ 4.48
RAPGEF6Q8TEU7 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.03■■■■■ 4.48
RAPGEF6Q8TEU7 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC43.03■■■■■ 4.48
RAPGEF6Q8TEU7 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.02■■■■■ 4.48
RAPGEF6Q8TEU7 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.01■■■■■ 4.48
RAPGEF6Q8TEU7 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.01■■■■■ 4.48
RAPGEF6Q8TEU7 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.01■■■■■ 4.47
RAPGEF6Q8TEU7 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC43■■■■■ 4.47
RAPGEF6Q8TEU7 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43■■■■■ 4.47
RAPGEF6Q8TEU7 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC42.99■■■■■ 4.47
RAPGEF6Q8TEU7 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC42.98■■■■■ 4.47
RAPGEF6Q8TEU7 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.97■■■■■ 4.47
RAPGEF6Q8TEU7 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC42.97■■■■■ 4.47
RAPGEF6Q8TEU7 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC42.96■■■■■ 4.47
RAPGEF6Q8TEU7 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.95■■■■■ 4.47
RAPGEF6Q8TEU7 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC42.93■■■■■ 4.46
RAPGEF6Q8TEU7 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.93■■■■■ 4.46
RAPGEF6Q8TEU7 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC42.92■■■■■ 4.46
RAPGEF6Q8TEU7 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC42.91■■■■■ 4.46
RAPGEF6Q8TEU7 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.91■■■■■ 4.46
RAPGEF6Q8TEU7 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.9■■■■■ 4.46
RAPGEF6Q8TEU7 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC42.9■■■■■ 4.46
RAPGEF6Q8TEU7 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.89■■■■■ 4.46
RAPGEF6Q8TEU7 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC42.89■■■■■ 4.46
RAPGEF6Q8TEU7 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.86■■■■■ 4.45
RAPGEF6Q8TEU7 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC42.86■■■■■ 4.45
RAPGEF6Q8TEU7 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC42.85■■■■■ 4.45
RAPGEF6Q8TEU7 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC42.85■■■■■ 4.45
RAPGEF6Q8TEU7 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC42.85■■■■■ 4.45
RAPGEF6Q8TEU7 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC42.84■■■■■ 4.45
RAPGEF6Q8TEU7 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC42.83■■■■■ 4.45
RAPGEF6Q8TEU7 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.83■■■■■ 4.45
RAPGEF6Q8TEU7 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.83■■■■■ 4.45
RAPGEF6Q8TEU7 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC42.82■■■■■ 4.45
RAPGEF6Q8TEU7 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC42.82■■■■■ 4.45
RAPGEF6Q8TEU7 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC42.82■■■■■ 4.44
RAPGEF6Q8TEU7 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC42.8■■■■■ 4.44
RAPGEF6Q8TEU7 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC42.77■■■■■ 4.44
RAPGEF6Q8TEU7 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.77■■■■■ 4.44
RAPGEF6Q8TEU7 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC42.76■■■■■ 4.44
RAPGEF6Q8TEU7 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.76■■■■■ 4.44
RAPGEF6Q8TEU7 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.75■■■■■ 4.43
RAPGEF6Q8TEU7 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC42.75■■■■■ 4.43
RAPGEF6Q8TEU7 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC42.75■■■■■ 4.43
RAPGEF6Q8TEU7 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC42.74■■■■■ 4.43
RAPGEF6Q8TEU7 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC42.74■■■■■ 4.43
RAPGEF6Q8TEU7 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC42.73■■■■■ 4.43
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