Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBN0

RAB3IL1, Guanine nucleotide exchange factor for Rab-3A, humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3IL1Q8TBN0 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RAB3IL1Q8TBN0 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RAB3IL1Q8TBN0 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RAB3IL1Q8TBN0 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RAB3IL1Q8TBN0 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RAB3IL1Q8TBN0 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RAB3IL1Q8TBN0 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RAB3IL1Q8TBN0 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RAB3IL1Q8TBN0 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RAB3IL1Q8TBN0 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RAB3IL1Q8TBN0 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RAB3IL1Q8TBN0 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RAB3IL1Q8TBN0 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RAB3IL1Q8TBN0 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RAB3IL1Q8TBN0 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RAB3IL1Q8TBN0 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
RAB3IL1Q8TBN0 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RAB3IL1Q8TBN0 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RAB3IL1Q8TBN0 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RAB3IL1Q8TBN0 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RAB3IL1Q8TBN0 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RAB3IL1Q8TBN0 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RAB3IL1Q8TBN0 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RAB3IL1Q8TBN0 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RAB3IL1Q8TBN0 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RAB3IL1Q8TBN0 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RAB3IL1Q8TBN0 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RAB3IL1Q8TBN0 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RAB3IL1Q8TBN0 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RAB3IL1Q8TBN0 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RAB3IL1Q8TBN0 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RAB3IL1Q8TBN0 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RAB3IL1Q8TBN0 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RAB3IL1Q8TBN0 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RAB3IL1Q8TBN0 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RAB3IL1Q8TBN0 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
RAB3IL1Q8TBN0 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RAB3IL1Q8TBN0 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RAB3IL1Q8TBN0 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RAB3IL1Q8TBN0 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RAB3IL1Q8TBN0 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RAB3IL1Q8TBN0 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RAB3IL1Q8TBN0 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RAB3IL1Q8TBN0 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RAB3IL1Q8TBN0 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RAB3IL1Q8TBN0 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
RAB3IL1Q8TBN0 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
RAB3IL1Q8TBN0 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RAB3IL1Q8TBN0 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RAB3IL1Q8TBN0 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RAB3IL1Q8TBN0 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RAB3IL1Q8TBN0 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RAB3IL1Q8TBN0 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RAB3IL1Q8TBN0 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
RAB3IL1Q8TBN0 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RAB3IL1Q8TBN0 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RAB3IL1Q8TBN0 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RAB3IL1Q8TBN0 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RAB3IL1Q8TBN0 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RAB3IL1Q8TBN0 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RAB3IL1Q8TBN0 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
RAB3IL1Q8TBN0 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
RAB3IL1Q8TBN0 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RAB3IL1Q8TBN0 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RAB3IL1Q8TBN0 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RAB3IL1Q8TBN0 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RAB3IL1Q8TBN0 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RAB3IL1Q8TBN0 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RAB3IL1Q8TBN0 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RAB3IL1Q8TBN0 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RAB3IL1Q8TBN0 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RAB3IL1Q8TBN0 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RAB3IL1Q8TBN0 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RAB3IL1Q8TBN0 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RAB3IL1Q8TBN0 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
RAB3IL1Q8TBN0 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RAB3IL1Q8TBN0 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RAB3IL1Q8TBN0 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RAB3IL1Q8TBN0 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RAB3IL1Q8TBN0 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RAB3IL1Q8TBN0 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.84
RAB3IL1Q8TBN0 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RAB3IL1Q8TBN0 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RAB3IL1Q8TBN0 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RAB3IL1Q8TBN0 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RAB3IL1Q8TBN0 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RAB3IL1Q8TBN0 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RAB3IL1Q8TBN0 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RAB3IL1Q8TBN0 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RAB3IL1Q8TBN0 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RAB3IL1Q8TBN0 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
RAB3IL1Q8TBN0 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RAB3IL1Q8TBN0 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RAB3IL1Q8TBN0 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RAB3IL1Q8TBN0 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RAB3IL1Q8TBN0 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RAB3IL1Q8TBN0 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.83
RAB3IL1Q8TBN0 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
RAB3IL1Q8TBN0 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
RAB3IL1Q8TBN0 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms