Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBE3

FNDC9, Fibronectin type III domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC9Q8TBE3 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FNDC9Q8TBE3 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FNDC9Q8TBE3 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
FNDC9Q8TBE3 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FNDC9Q8TBE3 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FNDC9Q8TBE3 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FNDC9Q8TBE3 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FNDC9Q8TBE3 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FNDC9Q8TBE3 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FNDC9Q8TBE3 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FNDC9Q8TBE3 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FNDC9Q8TBE3 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FNDC9Q8TBE3 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FNDC9Q8TBE3 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FNDC9Q8TBE3 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FNDC9Q8TBE3 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FNDC9Q8TBE3 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FNDC9Q8TBE3 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FNDC9Q8TBE3 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
FNDC9Q8TBE3 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FNDC9Q8TBE3 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
FNDC9Q8TBE3 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FNDC9Q8TBE3 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FNDC9Q8TBE3 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FNDC9Q8TBE3 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FNDC9Q8TBE3 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FNDC9Q8TBE3 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FNDC9Q8TBE3 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FNDC9Q8TBE3 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FNDC9Q8TBE3 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
FNDC9Q8TBE3 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FNDC9Q8TBE3 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
FNDC9Q8TBE3 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FNDC9Q8TBE3 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FNDC9Q8TBE3 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FNDC9Q8TBE3 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
FNDC9Q8TBE3 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FNDC9Q8TBE3 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FNDC9Q8TBE3 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
FNDC9Q8TBE3 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FNDC9Q8TBE3 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FNDC9Q8TBE3 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FNDC9Q8TBE3 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FNDC9Q8TBE3 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FNDC9Q8TBE3 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FNDC9Q8TBE3 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FNDC9Q8TBE3 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FNDC9Q8TBE3 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
FNDC9Q8TBE3 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FNDC9Q8TBE3 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FNDC9Q8TBE3 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FNDC9Q8TBE3 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FNDC9Q8TBE3 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FNDC9Q8TBE3 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FNDC9Q8TBE3 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FNDC9Q8TBE3 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FNDC9Q8TBE3 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FNDC9Q8TBE3 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FNDC9Q8TBE3 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FNDC9Q8TBE3 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FNDC9Q8TBE3 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FNDC9Q8TBE3 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FNDC9Q8TBE3 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FNDC9Q8TBE3 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FNDC9Q8TBE3 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FNDC9Q8TBE3 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FNDC9Q8TBE3 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
FNDC9Q8TBE3 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
FNDC9Q8TBE3 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FNDC9Q8TBE3 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FNDC9Q8TBE3 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FNDC9Q8TBE3 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
FNDC9Q8TBE3 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FNDC9Q8TBE3 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FNDC9Q8TBE3 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FNDC9Q8TBE3 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FNDC9Q8TBE3 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FNDC9Q8TBE3 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FNDC9Q8TBE3 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FNDC9Q8TBE3 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FNDC9Q8TBE3 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FNDC9Q8TBE3 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FNDC9Q8TBE3 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FNDC9Q8TBE3 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FNDC9Q8TBE3 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FNDC9Q8TBE3 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FNDC9Q8TBE3 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FNDC9Q8TBE3 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FNDC9Q8TBE3 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
FNDC9Q8TBE3 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
FNDC9Q8TBE3 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FNDC9Q8TBE3 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FNDC9Q8TBE3 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FNDC9Q8TBE3 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
FNDC9Q8TBE3 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FNDC9Q8TBE3 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FNDC9Q8TBE3 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FNDC9Q8TBE3 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FNDC9Q8TBE3 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FNDC9Q8TBE3 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms