Protein–RNA interactions for Protein: Q8R139

Slc29a4, Equilibrative nucleoside transporter 4, mousemouse

Predictions only

Length 528 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc29a4Q8R139 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Slc29a4Q8R139 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Slc29a4Q8R139 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Slc29a4Q8R139 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Slc29a4Q8R139 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Slc29a4Q8R139 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Slc29a4Q8R139 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Slc29a4Q8R139 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Slc29a4Q8R139 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Slc29a4Q8R139 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Slc29a4Q8R139 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Slc29a4Q8R139 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Slc29a4Q8R139 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Slc29a4Q8R139 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Slc29a4Q8R139 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Slc29a4Q8R139 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Slc29a4Q8R139 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Slc29a4Q8R139 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Slc29a4Q8R139 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Slc29a4Q8R139 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Slc29a4Q8R139 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Slc29a4Q8R139 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Slc29a4Q8R139 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Slc29a4Q8R139 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Slc29a4Q8R139 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Slc29a4Q8R139 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Slc29a4Q8R139 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Slc29a4Q8R139 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Slc29a4Q8R139 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Slc29a4Q8R139 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Slc29a4Q8R139 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Slc29a4Q8R139 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Slc29a4Q8R139 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Slc29a4Q8R139 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Slc29a4Q8R139 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Slc29a4Q8R139 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Slc29a4Q8R139 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Slc29a4Q8R139 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Slc29a4Q8R139 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Slc29a4Q8R139 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Slc29a4Q8R139 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Slc29a4Q8R139 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Slc29a4Q8R139 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Slc29a4Q8R139 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Slc29a4Q8R139 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Slc29a4Q8R139 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Slc29a4Q8R139 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Slc29a4Q8R139 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Slc29a4Q8R139 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Slc29a4Q8R139 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Slc29a4Q8R139 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Slc29a4Q8R139 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Slc29a4Q8R139 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Slc29a4Q8R139 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Slc29a4Q8R139 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Slc29a4Q8R139 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Slc29a4Q8R139 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Slc29a4Q8R139 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Slc29a4Q8R139 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Slc29a4Q8R139 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Slc29a4Q8R139 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Slc29a4Q8R139 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Slc29a4Q8R139 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Slc29a4Q8R139 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Slc29a4Q8R139 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Slc29a4Q8R139 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Slc29a4Q8R139 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Slc29a4Q8R139 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Slc29a4Q8R139 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Slc29a4Q8R139 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Slc29a4Q8R139 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Slc29a4Q8R139 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Slc29a4Q8R139 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Slc29a4Q8R139 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Slc29a4Q8R139 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Slc29a4Q8R139 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Slc29a4Q8R139 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Slc29a4Q8R139 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Slc29a4Q8R139 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Slc29a4Q8R139 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Slc29a4Q8R139 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Slc29a4Q8R139 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Slc29a4Q8R139 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Slc29a4Q8R139 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Slc29a4Q8R139 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Slc29a4Q8R139 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Slc29a4Q8R139 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Slc29a4Q8R139 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Slc29a4Q8R139 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Slc29a4Q8R139 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Slc29a4Q8R139 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Slc29a4Q8R139 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Slc29a4Q8R139 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Slc29a4Q8R139 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Slc29a4Q8R139 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Slc29a4Q8R139 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Slc29a4Q8R139 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Slc29a4Q8R139 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Slc29a4Q8R139 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Slc29a4Q8R139 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 111.5 ms