Protein–RNA interactions for Protein: Q8R105

Vps37c, Vacuolar protein sorting-associated protein 37C, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps37cQ8R105 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Vps37cQ8R105 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Vps37cQ8R105 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Vps37cQ8R105 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Vps37cQ8R105 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Vps37cQ8R105 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Vps37cQ8R105 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Vps37cQ8R105 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Vps37cQ8R105 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Vps37cQ8R105 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Vps37cQ8R105 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Vps37cQ8R105 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Vps37cQ8R105 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Vps37cQ8R105 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Vps37cQ8R105 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Vps37cQ8R105 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Vps37cQ8R105 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Vps37cQ8R105 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Vps37cQ8R105 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Vps37cQ8R105 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Vps37cQ8R105 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Vps37cQ8R105 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Vps37cQ8R105 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Vps37cQ8R105 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Vps37cQ8R105 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Vps37cQ8R105 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Vps37cQ8R105 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Vps37cQ8R105 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Vps37cQ8R105 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Vps37cQ8R105 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Vps37cQ8R105 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Vps37cQ8R105 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Vps37cQ8R105 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Vps37cQ8R105 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Vps37cQ8R105 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Vps37cQ8R105 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Vps37cQ8R105 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Vps37cQ8R105 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Vps37cQ8R105 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Vps37cQ8R105 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Vps37cQ8R105 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Vps37cQ8R105 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Vps37cQ8R105 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Vps37cQ8R105 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Vps37cQ8R105 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Vps37cQ8R105 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Vps37cQ8R105 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Vps37cQ8R105 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Vps37cQ8R105 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Vps37cQ8R105 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Vps37cQ8R105 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Vps37cQ8R105 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Vps37cQ8R105 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Vps37cQ8R105 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Vps37cQ8R105 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Vps37cQ8R105 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Vps37cQ8R105 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Vps37cQ8R105 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Vps37cQ8R105 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Vps37cQ8R105 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Vps37cQ8R105 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Vps37cQ8R105 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Vps37cQ8R105 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Vps37cQ8R105 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Vps37cQ8R105 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Vps37cQ8R105 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Vps37cQ8R105 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Vps37cQ8R105 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Vps37cQ8R105 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Vps37cQ8R105 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Vps37cQ8R105 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Vps37cQ8R105 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Vps37cQ8R105 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Vps37cQ8R105 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Vps37cQ8R105 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Vps37cQ8R105 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Vps37cQ8R105 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Vps37cQ8R105 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Vps37cQ8R105 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Vps37cQ8R105 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Vps37cQ8R105 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Vps37cQ8R105 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Vps37cQ8R105 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Vps37cQ8R105 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Vps37cQ8R105 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Vps37cQ8R105 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Vps37cQ8R105 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Vps37cQ8R105 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Vps37cQ8R105 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Vps37cQ8R105 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Vps37cQ8R105 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Vps37cQ8R105 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Vps37cQ8R105 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Vps37cQ8R105 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Vps37cQ8R105 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Vps37cQ8R105 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Vps37cQ8R105 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Vps37cQ8R105 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Vps37cQ8R105 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Vps37cQ8R105 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.4 ms