Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHS1

CLDND2, Claudin domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDND2Q8NHS1 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLDND2Q8NHS1 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLDND2Q8NHS1 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLDND2Q8NHS1 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLDND2Q8NHS1 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLDND2Q8NHS1 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLDND2Q8NHS1 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLDND2Q8NHS1 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLDND2Q8NHS1 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLDND2Q8NHS1 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLDND2Q8NHS1 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLDND2Q8NHS1 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLDND2Q8NHS1 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLDND2Q8NHS1 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLDND2Q8NHS1 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLDND2Q8NHS1 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLDND2Q8NHS1 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLDND2Q8NHS1 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CLDND2Q8NHS1 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLDND2Q8NHS1 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLDND2Q8NHS1 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLDND2Q8NHS1 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLDND2Q8NHS1 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLDND2Q8NHS1 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLDND2Q8NHS1 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLDND2Q8NHS1 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLDND2Q8NHS1 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLDND2Q8NHS1 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLDND2Q8NHS1 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLDND2Q8NHS1 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLDND2Q8NHS1 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CLDND2Q8NHS1 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLDND2Q8NHS1 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLDND2Q8NHS1 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLDND2Q8NHS1 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLDND2Q8NHS1 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLDND2Q8NHS1 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLDND2Q8NHS1 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CLDND2Q8NHS1 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CLDND2Q8NHS1 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLDND2Q8NHS1 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLDND2Q8NHS1 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLDND2Q8NHS1 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLDND2Q8NHS1 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLDND2Q8NHS1 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLDND2Q8NHS1 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLDND2Q8NHS1 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLDND2Q8NHS1 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLDND2Q8NHS1 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLDND2Q8NHS1 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLDND2Q8NHS1 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CLDND2Q8NHS1 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLDND2Q8NHS1 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLDND2Q8NHS1 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLDND2Q8NHS1 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLDND2Q8NHS1 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CLDND2Q8NHS1 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLDND2Q8NHS1 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLDND2Q8NHS1 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLDND2Q8NHS1 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLDND2Q8NHS1 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLDND2Q8NHS1 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CLDND2Q8NHS1 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CLDND2Q8NHS1 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CLDND2Q8NHS1 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLDND2Q8NHS1 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLDND2Q8NHS1 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLDND2Q8NHS1 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLDND2Q8NHS1 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLDND2Q8NHS1 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLDND2Q8NHS1 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLDND2Q8NHS1 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLDND2Q8NHS1 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLDND2Q8NHS1 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLDND2Q8NHS1 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLDND2Q8NHS1 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLDND2Q8NHS1 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLDND2Q8NHS1 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLDND2Q8NHS1 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLDND2Q8NHS1 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLDND2Q8NHS1 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLDND2Q8NHS1 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CLDND2Q8NHS1 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLDND2Q8NHS1 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLDND2Q8NHS1 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLDND2Q8NHS1 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLDND2Q8NHS1 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLDND2Q8NHS1 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLDND2Q8NHS1 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLDND2Q8NHS1 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLDND2Q8NHS1 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLDND2Q8NHS1 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLDND2Q8NHS1 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLDND2Q8NHS1 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLDND2Q8NHS1 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLDND2Q8NHS1 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLDND2Q8NHS1 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CLDND2Q8NHS1 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLDND2Q8NHS1 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLDND2Q8NHS1 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms