Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFQ6

BPIFC, BPI fold-containing family C protein, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPIFCQ8NFQ6 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BPIFCQ8NFQ6 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BPIFCQ8NFQ6 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BPIFCQ8NFQ6 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BPIFCQ8NFQ6 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BPIFCQ8NFQ6 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BPIFCQ8NFQ6 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BPIFCQ8NFQ6 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BPIFCQ8NFQ6 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BPIFCQ8NFQ6 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BPIFCQ8NFQ6 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BPIFCQ8NFQ6 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
BPIFCQ8NFQ6 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
BPIFCQ8NFQ6 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BPIFCQ8NFQ6 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BPIFCQ8NFQ6 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BPIFCQ8NFQ6 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BPIFCQ8NFQ6 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BPIFCQ8NFQ6 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BPIFCQ8NFQ6 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BPIFCQ8NFQ6 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BPIFCQ8NFQ6 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BPIFCQ8NFQ6 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BPIFCQ8NFQ6 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BPIFCQ8NFQ6 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BPIFCQ8NFQ6 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BPIFCQ8NFQ6 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BPIFCQ8NFQ6 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BPIFCQ8NFQ6 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BPIFCQ8NFQ6 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BPIFCQ8NFQ6 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BPIFCQ8NFQ6 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BPIFCQ8NFQ6 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BPIFCQ8NFQ6 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BPIFCQ8NFQ6 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BPIFCQ8NFQ6 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BPIFCQ8NFQ6 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BPIFCQ8NFQ6 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BPIFCQ8NFQ6 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BPIFCQ8NFQ6 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BPIFCQ8NFQ6 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BPIFCQ8NFQ6 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BPIFCQ8NFQ6 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BPIFCQ8NFQ6 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BPIFCQ8NFQ6 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BPIFCQ8NFQ6 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BPIFCQ8NFQ6 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BPIFCQ8NFQ6 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BPIFCQ8NFQ6 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BPIFCQ8NFQ6 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BPIFCQ8NFQ6 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BPIFCQ8NFQ6 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BPIFCQ8NFQ6 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BPIFCQ8NFQ6 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BPIFCQ8NFQ6 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BPIFCQ8NFQ6 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BPIFCQ8NFQ6 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BPIFCQ8NFQ6 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BPIFCQ8NFQ6 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BPIFCQ8NFQ6 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BPIFCQ8NFQ6 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BPIFCQ8NFQ6 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BPIFCQ8NFQ6 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BPIFCQ8NFQ6 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BPIFCQ8NFQ6 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
BPIFCQ8NFQ6 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
BPIFCQ8NFQ6 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
BPIFCQ8NFQ6 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BPIFCQ8NFQ6 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
BPIFCQ8NFQ6 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BPIFCQ8NFQ6 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BPIFCQ8NFQ6 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BPIFCQ8NFQ6 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BPIFCQ8NFQ6 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BPIFCQ8NFQ6 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BPIFCQ8NFQ6 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BPIFCQ8NFQ6 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BPIFCQ8NFQ6 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BPIFCQ8NFQ6 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BPIFCQ8NFQ6 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BPIFCQ8NFQ6 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BPIFCQ8NFQ6 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BPIFCQ8NFQ6 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BPIFCQ8NFQ6 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BPIFCQ8NFQ6 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BPIFCQ8NFQ6 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BPIFCQ8NFQ6 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BPIFCQ8NFQ6 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BPIFCQ8NFQ6 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BPIFCQ8NFQ6 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BPIFCQ8NFQ6 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BPIFCQ8NFQ6 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BPIFCQ8NFQ6 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
BPIFCQ8NFQ6 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BPIFCQ8NFQ6 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BPIFCQ8NFQ6 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BPIFCQ8NFQ6 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BPIFCQ8NFQ6 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BPIFCQ8NFQ6 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
BPIFCQ8NFQ6 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms