Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEU8

APPL2, DCC-interacting protein 13-beta, humanhuman

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APPL2Q8NEU8 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
APPL2Q8NEU8 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
APPL2Q8NEU8 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
APPL2Q8NEU8 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
APPL2Q8NEU8 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
APPL2Q8NEU8 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
APPL2Q8NEU8 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
APPL2Q8NEU8 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
APPL2Q8NEU8 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
APPL2Q8NEU8 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
APPL2Q8NEU8 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC29.18■■■□□ 2.26
APPL2Q8NEU8 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
APPL2Q8NEU8 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
APPL2Q8NEU8 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
APPL2Q8NEU8 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
APPL2Q8NEU8 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
APPL2Q8NEU8 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
APPL2Q8NEU8 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
APPL2Q8NEU8 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
APPL2Q8NEU8 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
APPL2Q8NEU8 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
APPL2Q8NEU8 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
APPL2Q8NEU8 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
APPL2Q8NEU8 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
APPL2Q8NEU8 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
APPL2Q8NEU8 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
APPL2Q8NEU8 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
APPL2Q8NEU8 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
APPL2Q8NEU8 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
APPL2Q8NEU8 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
APPL2Q8NEU8 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
APPL2Q8NEU8 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
APPL2Q8NEU8 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
APPL2Q8NEU8 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
APPL2Q8NEU8 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
APPL2Q8NEU8 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
APPL2Q8NEU8 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
APPL2Q8NEU8 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
APPL2Q8NEU8 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
APPL2Q8NEU8 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
APPL2Q8NEU8 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
APPL2Q8NEU8 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
APPL2Q8NEU8 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.23
APPL2Q8NEU8 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
APPL2Q8NEU8 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
APPL2Q8NEU8 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
APPL2Q8NEU8 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
APPL2Q8NEU8 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
APPL2Q8NEU8 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
APPL2Q8NEU8 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
APPL2Q8NEU8 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
APPL2Q8NEU8 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
APPL2Q8NEU8 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
APPL2Q8NEU8 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
APPL2Q8NEU8 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
APPL2Q8NEU8 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
APPL2Q8NEU8 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
APPL2Q8NEU8 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
APPL2Q8NEU8 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
APPL2Q8NEU8 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
APPL2Q8NEU8 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
APPL2Q8NEU8 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
APPL2Q8NEU8 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
APPL2Q8NEU8 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
APPL2Q8NEU8 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
APPL2Q8NEU8 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
APPL2Q8NEU8 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
APPL2Q8NEU8 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
APPL2Q8NEU8 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
APPL2Q8NEU8 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
APPL2Q8NEU8 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
APPL2Q8NEU8 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
APPL2Q8NEU8 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
APPL2Q8NEU8 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
APPL2Q8NEU8 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
APPL2Q8NEU8 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
APPL2Q8NEU8 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
APPL2Q8NEU8 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
APPL2Q8NEU8 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
APPL2Q8NEU8 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
APPL2Q8NEU8 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
APPL2Q8NEU8 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
APPL2Q8NEU8 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
APPL2Q8NEU8 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
APPL2Q8NEU8 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
APPL2Q8NEU8 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
APPL2Q8NEU8 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
APPL2Q8NEU8 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
APPL2Q8NEU8 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
APPL2Q8NEU8 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
APPL2Q8NEU8 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
APPL2Q8NEU8 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
APPL2Q8NEU8 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
APPL2Q8NEU8 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
APPL2Q8NEU8 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
APPL2Q8NEU8 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
APPL2Q8NEU8 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
APPL2Q8NEU8 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
APPL2Q8NEU8 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
APPL2Q8NEU8 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms