Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCN4

RNF169, E3 ubiquitin-protein ligase RNF169, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF169Q8NCN4 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
RNF169Q8NCN4 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
RNF169Q8NCN4 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
RNF169Q8NCN4 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
RNF169Q8NCN4 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
RNF169Q8NCN4 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
RNF169Q8NCN4 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
RNF169Q8NCN4 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
RNF169Q8NCN4 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
RNF169Q8NCN4 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
RNF169Q8NCN4 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
RNF169Q8NCN4 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
RNF169Q8NCN4 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
RNF169Q8NCN4 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
RNF169Q8NCN4 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
RNF169Q8NCN4 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
RNF169Q8NCN4 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
RNF169Q8NCN4 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
RNF169Q8NCN4 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
RNF169Q8NCN4 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
RNF169Q8NCN4 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
RNF169Q8NCN4 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
RNF169Q8NCN4 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
RNF169Q8NCN4 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
RNF169Q8NCN4 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
RNF169Q8NCN4 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
RNF169Q8NCN4 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
RNF169Q8NCN4 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
RNF169Q8NCN4 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
RNF169Q8NCN4 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
RNF169Q8NCN4 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
RNF169Q8NCN4 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
RNF169Q8NCN4 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
RNF169Q8NCN4 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
RNF169Q8NCN4 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
RNF169Q8NCN4 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
RNF169Q8NCN4 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
RNF169Q8NCN4 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
RNF169Q8NCN4 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
RNF169Q8NCN4 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
RNF169Q8NCN4 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
RNF169Q8NCN4 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
RNF169Q8NCN4 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
RNF169Q8NCN4 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
RNF169Q8NCN4 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
RNF169Q8NCN4 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
RNF169Q8NCN4 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
RNF169Q8NCN4 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
RNF169Q8NCN4 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
RNF169Q8NCN4 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
RNF169Q8NCN4 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
RNF169Q8NCN4 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
RNF169Q8NCN4 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
RNF169Q8NCN4 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
RNF169Q8NCN4 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
RNF169Q8NCN4 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
RNF169Q8NCN4 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
RNF169Q8NCN4 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
RNF169Q8NCN4 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
RNF169Q8NCN4 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
RNF169Q8NCN4 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
RNF169Q8NCN4 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
RNF169Q8NCN4 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
RNF169Q8NCN4 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
RNF169Q8NCN4 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
RNF169Q8NCN4 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
RNF169Q8NCN4 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
RNF169Q8NCN4 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
RNF169Q8NCN4 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
RNF169Q8NCN4 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
RNF169Q8NCN4 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
RNF169Q8NCN4 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
RNF169Q8NCN4 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
RNF169Q8NCN4 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
RNF169Q8NCN4 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
RNF169Q8NCN4 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
RNF169Q8NCN4 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
RNF169Q8NCN4 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
RNF169Q8NCN4 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
RNF169Q8NCN4 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
RNF169Q8NCN4 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
RNF169Q8NCN4 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
RNF169Q8NCN4 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC29.29■■■□□ 2.28
RNF169Q8NCN4 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
RNF169Q8NCN4 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
RNF169Q8NCN4 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
RNF169Q8NCN4 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
RNF169Q8NCN4 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
RNF169Q8NCN4 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC29.27■■■□□ 2.28
RNF169Q8NCN4 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
RNF169Q8NCN4 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
RNF169Q8NCN4 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
RNF169Q8NCN4 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
RNF169Q8NCN4 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
RNF169Q8NCN4 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
RNF169Q8NCN4 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
RNF169Q8NCN4 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
RNF169Q8NCN4 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
RNF169Q8NCN4 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
RNF169Q8NCN4 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms