Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBF2

NHLRC2, NHL repeat-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLRC2Q8NBF2 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NHLRC2Q8NBF2 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NHLRC2Q8NBF2 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
NHLRC2Q8NBF2 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NHLRC2Q8NBF2 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NHLRC2Q8NBF2 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NHLRC2Q8NBF2 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NHLRC2Q8NBF2 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NHLRC2Q8NBF2 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NHLRC2Q8NBF2 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NHLRC2Q8NBF2 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NHLRC2Q8NBF2 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NHLRC2Q8NBF2 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NHLRC2Q8NBF2 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NHLRC2Q8NBF2 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NHLRC2Q8NBF2 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NHLRC2Q8NBF2 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NHLRC2Q8NBF2 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NHLRC2Q8NBF2 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NHLRC2Q8NBF2 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NHLRC2Q8NBF2 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
NHLRC2Q8NBF2 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NHLRC2Q8NBF2 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NHLRC2Q8NBF2 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NHLRC2Q8NBF2 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NHLRC2Q8NBF2 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NHLRC2Q8NBF2 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NHLRC2Q8NBF2 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NHLRC2Q8NBF2 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NHLRC2Q8NBF2 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NHLRC2Q8NBF2 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
NHLRC2Q8NBF2 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.91
NHLRC2Q8NBF2 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
NHLRC2Q8NBF2 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
NHLRC2Q8NBF2 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
NHLRC2Q8NBF2 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
NHLRC2Q8NBF2 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
NHLRC2Q8NBF2 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NHLRC2Q8NBF2 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NHLRC2Q8NBF2 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
NHLRC2Q8NBF2 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NHLRC2Q8NBF2 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NHLRC2Q8NBF2 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
NHLRC2Q8NBF2 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NHLRC2Q8NBF2 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NHLRC2Q8NBF2 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NHLRC2Q8NBF2 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NHLRC2Q8NBF2 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NHLRC2Q8NBF2 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NHLRC2Q8NBF2 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NHLRC2Q8NBF2 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NHLRC2Q8NBF2 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NHLRC2Q8NBF2 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NHLRC2Q8NBF2 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NHLRC2Q8NBF2 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NHLRC2Q8NBF2 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NHLRC2Q8NBF2 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NHLRC2Q8NBF2 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NHLRC2Q8NBF2 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NHLRC2Q8NBF2 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NHLRC2Q8NBF2 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
NHLRC2Q8NBF2 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NHLRC2Q8NBF2 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NHLRC2Q8NBF2 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NHLRC2Q8NBF2 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NHLRC2Q8NBF2 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NHLRC2Q8NBF2 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NHLRC2Q8NBF2 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NHLRC2Q8NBF2 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NHLRC2Q8NBF2 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NHLRC2Q8NBF2 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NHLRC2Q8NBF2 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NHLRC2Q8NBF2 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NHLRC2Q8NBF2 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NHLRC2Q8NBF2 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NHLRC2Q8NBF2 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NHLRC2Q8NBF2 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NHLRC2Q8NBF2 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NHLRC2Q8NBF2 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NHLRC2Q8NBF2 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NHLRC2Q8NBF2 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NHLRC2Q8NBF2 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NHLRC2Q8NBF2 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NHLRC2Q8NBF2 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NHLRC2Q8NBF2 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NHLRC2Q8NBF2 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NHLRC2Q8NBF2 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NHLRC2Q8NBF2 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NHLRC2Q8NBF2 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NHLRC2Q8NBF2 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NHLRC2Q8NBF2 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
NHLRC2Q8NBF2 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NHLRC2Q8NBF2 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NHLRC2Q8NBF2 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NHLRC2Q8NBF2 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NHLRC2Q8NBF2 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NHLRC2Q8NBF2 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NHLRC2Q8NBF2 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NHLRC2Q8NBF2 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NHLRC2Q8NBF2 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms