Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9L1

ZIC4, Zinc finger protein ZIC 4, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC4Q8N9L1 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZIC4Q8N9L1 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZIC4Q8N9L1 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZIC4Q8N9L1 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZIC4Q8N9L1 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZIC4Q8N9L1 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZIC4Q8N9L1 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZIC4Q8N9L1 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
ZIC4Q8N9L1 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZIC4Q8N9L1 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZIC4Q8N9L1 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
ZIC4Q8N9L1 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZIC4Q8N9L1 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZIC4Q8N9L1 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZIC4Q8N9L1 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZIC4Q8N9L1 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZIC4Q8N9L1 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZIC4Q8N9L1 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZIC4Q8N9L1 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
ZIC4Q8N9L1 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZIC4Q8N9L1 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZIC4Q8N9L1 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZIC4Q8N9L1 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZIC4Q8N9L1 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZIC4Q8N9L1 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZIC4Q8N9L1 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZIC4Q8N9L1 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZIC4Q8N9L1 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZIC4Q8N9L1 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZIC4Q8N9L1 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZIC4Q8N9L1 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZIC4Q8N9L1 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZIC4Q8N9L1 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZIC4Q8N9L1 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZIC4Q8N9L1 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZIC4Q8N9L1 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZIC4Q8N9L1 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ZIC4Q8N9L1 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ZIC4Q8N9L1 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZIC4Q8N9L1 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
ZIC4Q8N9L1 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZIC4Q8N9L1 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZIC4Q8N9L1 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZIC4Q8N9L1 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZIC4Q8N9L1 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZIC4Q8N9L1 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZIC4Q8N9L1 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZIC4Q8N9L1 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZIC4Q8N9L1 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZIC4Q8N9L1 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZIC4Q8N9L1 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZIC4Q8N9L1 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZIC4Q8N9L1 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZIC4Q8N9L1 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZIC4Q8N9L1 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZIC4Q8N9L1 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZIC4Q8N9L1 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZIC4Q8N9L1 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZIC4Q8N9L1 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
ZIC4Q8N9L1 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZIC4Q8N9L1 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
ZIC4Q8N9L1 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ZIC4Q8N9L1 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ZIC4Q8N9L1 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ZIC4Q8N9L1 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZIC4Q8N9L1 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZIC4Q8N9L1 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZIC4Q8N9L1 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZIC4Q8N9L1 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZIC4Q8N9L1 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZIC4Q8N9L1 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZIC4Q8N9L1 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZIC4Q8N9L1 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZIC4Q8N9L1 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZIC4Q8N9L1 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZIC4Q8N9L1 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZIC4Q8N9L1 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZIC4Q8N9L1 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
ZIC4Q8N9L1 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
ZIC4Q8N9L1 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZIC4Q8N9L1 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZIC4Q8N9L1 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZIC4Q8N9L1 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZIC4Q8N9L1 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZIC4Q8N9L1 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZIC4Q8N9L1 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZIC4Q8N9L1 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZIC4Q8N9L1 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZIC4Q8N9L1 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZIC4Q8N9L1 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZIC4Q8N9L1 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ZIC4Q8N9L1 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ZIC4Q8N9L1 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZIC4Q8N9L1 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZIC4Q8N9L1 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZIC4Q8N9L1 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZIC4Q8N9L1 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZIC4Q8N9L1 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZIC4Q8N9L1 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZIC4Q8N9L1 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms