Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9B4

ANKRD42, Ankyrin repeat domain-containing protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD42Q8N9B4 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ANKRD42Q8N9B4 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ANKRD42Q8N9B4 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ANKRD42Q8N9B4 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ANKRD42Q8N9B4 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ANKRD42Q8N9B4 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ANKRD42Q8N9B4 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ANKRD42Q8N9B4 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ANKRD42Q8N9B4 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ANKRD42Q8N9B4 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ANKRD42Q8N9B4 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ANKRD42Q8N9B4 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ANKRD42Q8N9B4 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ANKRD42Q8N9B4 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ANKRD42Q8N9B4 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ANKRD42Q8N9B4 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ANKRD42Q8N9B4 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ANKRD42Q8N9B4 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ANKRD42Q8N9B4 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ANKRD42Q8N9B4 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ANKRD42Q8N9B4 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ANKRD42Q8N9B4 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ANKRD42Q8N9B4 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ANKRD42Q8N9B4 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ANKRD42Q8N9B4 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ANKRD42Q8N9B4 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ANKRD42Q8N9B4 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ANKRD42Q8N9B4 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ANKRD42Q8N9B4 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ANKRD42Q8N9B4 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ANKRD42Q8N9B4 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ANKRD42Q8N9B4 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ANKRD42Q8N9B4 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
ANKRD42Q8N9B4 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ANKRD42Q8N9B4 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ANKRD42Q8N9B4 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ANKRD42Q8N9B4 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ANKRD42Q8N9B4 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ANKRD42Q8N9B4 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ANKRD42Q8N9B4 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ANKRD42Q8N9B4 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ANKRD42Q8N9B4 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ANKRD42Q8N9B4 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ANKRD42Q8N9B4 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
ANKRD42Q8N9B4 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ANKRD42Q8N9B4 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ANKRD42Q8N9B4 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ANKRD42Q8N9B4 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ANKRD42Q8N9B4 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ANKRD42Q8N9B4 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ANKRD42Q8N9B4 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ANKRD42Q8N9B4 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ANKRD42Q8N9B4 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ANKRD42Q8N9B4 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
ANKRD42Q8N9B4 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ANKRD42Q8N9B4 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ANKRD42Q8N9B4 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ANKRD42Q8N9B4 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ANKRD42Q8N9B4 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ANKRD42Q8N9B4 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ANKRD42Q8N9B4 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ANKRD42Q8N9B4 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ANKRD42Q8N9B4 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ANKRD42Q8N9B4 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ANKRD42Q8N9B4 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
ANKRD42Q8N9B4 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ANKRD42Q8N9B4 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ANKRD42Q8N9B4 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ANKRD42Q8N9B4 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ANKRD42Q8N9B4 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ANKRD42Q8N9B4 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ANKRD42Q8N9B4 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ANKRD42Q8N9B4 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ANKRD42Q8N9B4 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ANKRD42Q8N9B4 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ANKRD42Q8N9B4 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ANKRD42Q8N9B4 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ANKRD42Q8N9B4 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ANKRD42Q8N9B4 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ANKRD42Q8N9B4 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ANKRD42Q8N9B4 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ANKRD42Q8N9B4 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ANKRD42Q8N9B4 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ANKRD42Q8N9B4 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ANKRD42Q8N9B4 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ANKRD42Q8N9B4 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ANKRD42Q8N9B4 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ANKRD42Q8N9B4 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ANKRD42Q8N9B4 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ANKRD42Q8N9B4 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
ANKRD42Q8N9B4 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ANKRD42Q8N9B4 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ANKRD42Q8N9B4 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ANKRD42Q8N9B4 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ANKRD42Q8N9B4 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ANKRD42Q8N9B4 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ANKRD42Q8N9B4 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ANKRD42Q8N9B4 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
ANKRD42Q8N9B4 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ANKRD42Q8N9B4 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms