Protein–RNA interactions for Protein: Q8N944

AMER3, APC membrane recruitment protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 861 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMER3Q8N944 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
AMER3Q8N944 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
AMER3Q8N944 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
AMER3Q8N944 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
AMER3Q8N944 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
AMER3Q8N944 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26■■□□□ 1.75
AMER3Q8N944 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
AMER3Q8N944 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
AMER3Q8N944 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
AMER3Q8N944 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
AMER3Q8N944 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
AMER3Q8N944 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
AMER3Q8N944 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
AMER3Q8N944 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
AMER3Q8N944 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
AMER3Q8N944 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
AMER3Q8N944 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
AMER3Q8N944 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
AMER3Q8N944 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
AMER3Q8N944 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
AMER3Q8N944 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
AMER3Q8N944 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
AMER3Q8N944 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
AMER3Q8N944 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
AMER3Q8N944 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
AMER3Q8N944 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
AMER3Q8N944 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
AMER3Q8N944 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
AMER3Q8N944 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
AMER3Q8N944 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
AMER3Q8N944 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
AMER3Q8N944 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
AMER3Q8N944 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
AMER3Q8N944 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
AMER3Q8N944 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
AMER3Q8N944 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
AMER3Q8N944 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
AMER3Q8N944 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
AMER3Q8N944 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
AMER3Q8N944 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
AMER3Q8N944 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
AMER3Q8N944 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
AMER3Q8N944 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
AMER3Q8N944 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
AMER3Q8N944 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
AMER3Q8N944 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
AMER3Q8N944 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
AMER3Q8N944 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
AMER3Q8N944 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
AMER3Q8N944 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
AMER3Q8N944 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
AMER3Q8N944 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
AMER3Q8N944 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
AMER3Q8N944 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
AMER3Q8N944 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
AMER3Q8N944 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
AMER3Q8N944 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
AMER3Q8N944 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
AMER3Q8N944 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
AMER3Q8N944 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
AMER3Q8N944 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
AMER3Q8N944 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
AMER3Q8N944 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
AMER3Q8N944 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
AMER3Q8N944 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
AMER3Q8N944 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
AMER3Q8N944 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
AMER3Q8N944 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
AMER3Q8N944 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
AMER3Q8N944 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
AMER3Q8N944 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
AMER3Q8N944 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
AMER3Q8N944 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
AMER3Q8N944 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
AMER3Q8N944 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
AMER3Q8N944 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
AMER3Q8N944 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
AMER3Q8N944 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
AMER3Q8N944 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
AMER3Q8N944 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
AMER3Q8N944 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
AMER3Q8N944 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
AMER3Q8N944 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
AMER3Q8N944 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
AMER3Q8N944 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
AMER3Q8N944 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
AMER3Q8N944 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
AMER3Q8N944 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
AMER3Q8N944 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
AMER3Q8N944 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
AMER3Q8N944 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
AMER3Q8N944 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
AMER3Q8N944 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
AMER3Q8N944 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
AMER3Q8N944 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
AMER3Q8N944 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
AMER3Q8N944 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
AMER3Q8N944 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
AMER3Q8N944 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
AMER3Q8N944 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.6 ms