Protein–RNA interactions for Protein: Q8N7Z2

GOLGA6L1, Golgin subfamily A member 6-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L1Q8N7Z2 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
GOLGA6L1Q8N7Z2 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.12
GOLGA6L1Q8N7Z2 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
GOLGA6L1Q8N7Z2 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
GOLGA6L1Q8N7Z2 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
GOLGA6L1Q8N7Z2 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
GOLGA6L1Q8N7Z2 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
GOLGA6L1Q8N7Z2 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
GOLGA6L1Q8N7Z2 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
GOLGA6L1Q8N7Z2 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
GOLGA6L1Q8N7Z2 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
GOLGA6L1Q8N7Z2 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
GOLGA6L1Q8N7Z2 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
GOLGA6L1Q8N7Z2 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
GOLGA6L1Q8N7Z2 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
GOLGA6L1Q8N7Z2 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
GOLGA6L1Q8N7Z2 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
GOLGA6L1Q8N7Z2 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
GOLGA6L1Q8N7Z2 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
GOLGA6L1Q8N7Z2 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
GOLGA6L1Q8N7Z2 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
GOLGA6L1Q8N7Z2 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
GOLGA6L1Q8N7Z2 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
GOLGA6L1Q8N7Z2 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
GOLGA6L1Q8N7Z2 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
GOLGA6L1Q8N7Z2 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
GOLGA6L1Q8N7Z2 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
GOLGA6L1Q8N7Z2 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
GOLGA6L1Q8N7Z2 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GOLGA6L1Q8N7Z2 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
GOLGA6L1Q8N7Z2 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GOLGA6L1Q8N7Z2 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
GOLGA6L1Q8N7Z2 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
GOLGA6L1Q8N7Z2 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
GOLGA6L1Q8N7Z2 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GOLGA6L1Q8N7Z2 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GOLGA6L1Q8N7Z2 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
GOLGA6L1Q8N7Z2 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
GOLGA6L1Q8N7Z2 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GOLGA6L1Q8N7Z2 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GOLGA6L1Q8N7Z2 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GOLGA6L1Q8N7Z2 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GOLGA6L1Q8N7Z2 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
GOLGA6L1Q8N7Z2 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
GOLGA6L1Q8N7Z2 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
GOLGA6L1Q8N7Z2 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
GOLGA6L1Q8N7Z2 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
GOLGA6L1Q8N7Z2 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
GOLGA6L1Q8N7Z2 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
GOLGA6L1Q8N7Z2 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
GOLGA6L1Q8N7Z2 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GOLGA6L1Q8N7Z2 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
GOLGA6L1Q8N7Z2 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
GOLGA6L1Q8N7Z2 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
GOLGA6L1Q8N7Z2 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
GOLGA6L1Q8N7Z2 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
GOLGA6L1Q8N7Z2 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
GOLGA6L1Q8N7Z2 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
GOLGA6L1Q8N7Z2 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
GOLGA6L1Q8N7Z2 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
GOLGA6L1Q8N7Z2 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
GOLGA6L1Q8N7Z2 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
GOLGA6L1Q8N7Z2 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
GOLGA6L1Q8N7Z2 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
GOLGA6L1Q8N7Z2 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
GOLGA6L1Q8N7Z2 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
GOLGA6L1Q8N7Z2 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
GOLGA6L1Q8N7Z2 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
GOLGA6L1Q8N7Z2 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
GOLGA6L1Q8N7Z2 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
GOLGA6L1Q8N7Z2 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
GOLGA6L1Q8N7Z2 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
GOLGA6L1Q8N7Z2 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
GOLGA6L1Q8N7Z2 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
GOLGA6L1Q8N7Z2 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
GOLGA6L1Q8N7Z2 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
GOLGA6L1Q8N7Z2 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
GOLGA6L1Q8N7Z2 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
GOLGA6L1Q8N7Z2 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
GOLGA6L1Q8N7Z2 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
GOLGA6L1Q8N7Z2 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
GOLGA6L1Q8N7Z2 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
GOLGA6L1Q8N7Z2 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
GOLGA6L1Q8N7Z2 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
GOLGA6L1Q8N7Z2 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
GOLGA6L1Q8N7Z2 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
GOLGA6L1Q8N7Z2 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
GOLGA6L1Q8N7Z2 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
GOLGA6L1Q8N7Z2 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
GOLGA6L1Q8N7Z2 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
GOLGA6L1Q8N7Z2 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
GOLGA6L1Q8N7Z2 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
GOLGA6L1Q8N7Z2 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
GOLGA6L1Q8N7Z2 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
GOLGA6L1Q8N7Z2 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
GOLGA6L1Q8N7Z2 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
GOLGA6L1Q8N7Z2 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
GOLGA6L1Q8N7Z2 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
GOLGA6L1Q8N7Z2 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
GOLGA6L1Q8N7Z2 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms